Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE3

Lysmd3, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lysmd3Q99LE3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lysmd3Q99LE3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lysmd3Q99LE3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lysmd3Q99LE3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lysmd3Q99LE3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lysmd3Q99LE3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lysmd3Q99LE3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lysmd3Q99LE3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Lysmd3Q99LE3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lysmd3Q99LE3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lysmd3Q99LE3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lysmd3Q99LE3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lysmd3Q99LE3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lysmd3Q99LE3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lysmd3Q99LE3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lysmd3Q99LE3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lysmd3Q99LE3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lysmd3Q99LE3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lysmd3Q99LE3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lysmd3Q99LE3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lysmd3Q99LE3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lysmd3Q99LE3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lysmd3Q99LE3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lysmd3Q99LE3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Lysmd3Q99LE3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lysmd3Q99LE3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lysmd3Q99LE3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lysmd3Q99LE3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lysmd3Q99LE3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lysmd3Q99LE3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lysmd3Q99LE3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lysmd3Q99LE3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lysmd3Q99LE3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lysmd3Q99LE3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lysmd3Q99LE3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lysmd3Q99LE3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lysmd3Q99LE3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lysmd3Q99LE3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lysmd3Q99LE3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lysmd3Q99LE3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lysmd3Q99LE3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lysmd3Q99LE3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lysmd3Q99LE3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lysmd3Q99LE3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lysmd3Q99LE3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lysmd3Q99LE3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lysmd3Q99LE3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lysmd3Q99LE3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lysmd3Q99LE3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Lysmd3Q99LE3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lysmd3Q99LE3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lysmd3Q99LE3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lysmd3Q99LE3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lysmd3Q99LE3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lysmd3Q99LE3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lysmd3Q99LE3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Lysmd3Q99LE3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lysmd3Q99LE3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lysmd3Q99LE3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lysmd3Q99LE3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Lysmd3Q99LE3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Lysmd3Q99LE3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lysmd3Q99LE3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lysmd3Q99LE3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lysmd3Q99LE3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lysmd3Q99LE3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lysmd3Q99LE3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lysmd3Q99LE3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lysmd3Q99LE3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lysmd3Q99LE3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lysmd3Q99LE3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lysmd3Q99LE3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lysmd3Q99LE3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lysmd3Q99LE3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lysmd3Q99LE3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lysmd3Q99LE3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lysmd3Q99LE3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lysmd3Q99LE3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lysmd3Q99LE3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lysmd3Q99LE3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lysmd3Q99LE3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lysmd3Q99LE3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lysmd3Q99LE3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lysmd3Q99LE3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Lysmd3Q99LE3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lysmd3Q99LE3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lysmd3Q99LE3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lysmd3Q99LE3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lysmd3Q99LE3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lysmd3Q99LE3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lysmd3Q99LE3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lysmd3Q99LE3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lysmd3Q99LE3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lysmd3Q99LE3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Lysmd3Q99LE3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lysmd3Q99LE3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Lysmd3Q99LE3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lysmd3Q99LE3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lysmd3Q99LE3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lysmd3Q99LE3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms