Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR3

Lactb2, Endoribonuclease LACTB2, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactb2Q99KR3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lactb2Q99KR3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lactb2Q99KR3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Lactb2Q99KR3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Lactb2Q99KR3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lactb2Q99KR3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lactb2Q99KR3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lactb2Q99KR3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lactb2Q99KR3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lactb2Q99KR3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lactb2Q99KR3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lactb2Q99KR3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lactb2Q99KR3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Lactb2Q99KR3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Lactb2Q99KR3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lactb2Q99KR3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lactb2Q99KR3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lactb2Q99KR3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lactb2Q99KR3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lactb2Q99KR3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Lactb2Q99KR3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Lactb2Q99KR3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Lactb2Q99KR3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lactb2Q99KR3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lactb2Q99KR3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lactb2Q99KR3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lactb2Q99KR3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lactb2Q99KR3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Lactb2Q99KR3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lactb2Q99KR3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lactb2Q99KR3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lactb2Q99KR3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lactb2Q99KR3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lactb2Q99KR3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lactb2Q99KR3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lactb2Q99KR3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lactb2Q99KR3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lactb2Q99KR3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lactb2Q99KR3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lactb2Q99KR3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lactb2Q99KR3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lactb2Q99KR3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lactb2Q99KR3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Lactb2Q99KR3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lactb2Q99KR3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lactb2Q99KR3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lactb2Q99KR3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lactb2Q99KR3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lactb2Q99KR3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Lactb2Q99KR3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lactb2Q99KR3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lactb2Q99KR3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lactb2Q99KR3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lactb2Q99KR3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lactb2Q99KR3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lactb2Q99KR3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lactb2Q99KR3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lactb2Q99KR3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lactb2Q99KR3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lactb2Q99KR3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lactb2Q99KR3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lactb2Q99KR3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lactb2Q99KR3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lactb2Q99KR3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lactb2Q99KR3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lactb2Q99KR3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lactb2Q99KR3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lactb2Q99KR3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lactb2Q99KR3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lactb2Q99KR3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lactb2Q99KR3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lactb2Q99KR3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lactb2Q99KR3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lactb2Q99KR3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lactb2Q99KR3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lactb2Q99KR3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lactb2Q99KR3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lactb2Q99KR3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lactb2Q99KR3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lactb2Q99KR3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lactb2Q99KR3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lactb2Q99KR3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lactb2Q99KR3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lactb2Q99KR3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lactb2Q99KR3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lactb2Q99KR3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lactb2Q99KR3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lactb2Q99KR3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lactb2Q99KR3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lactb2Q99KR3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lactb2Q99KR3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Lactb2Q99KR3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lactb2Q99KR3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lactb2Q99KR3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lactb2Q99KR3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lactb2Q99KR3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lactb2Q99KR3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lactb2Q99KR3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lactb2Q99KR3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lactb2Q99KR3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms