Protein–RNA interactions for Protein: Q99K01

Pdxdc1, Pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdxdc1Q99K01 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pdxdc1Q99K01 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdxdc1Q99K01 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdxdc1Q99K01 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdxdc1Q99K01 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdxdc1Q99K01 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdxdc1Q99K01 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdxdc1Q99K01 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdxdc1Q99K01 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdxdc1Q99K01 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pdxdc1Q99K01 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Pdxdc1Q99K01 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pdxdc1Q99K01 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdxdc1Q99K01 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdxdc1Q99K01 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdxdc1Q99K01 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdxdc1Q99K01 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pdxdc1Q99K01 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pdxdc1Q99K01 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pdxdc1Q99K01 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Pdxdc1Q99K01 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pdxdc1Q99K01 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdxdc1Q99K01 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdxdc1Q99K01 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdxdc1Q99K01 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdxdc1Q99K01 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdxdc1Q99K01 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdxdc1Q99K01 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdxdc1Q99K01 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdxdc1Q99K01 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdxdc1Q99K01 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdxdc1Q99K01 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdxdc1Q99K01 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdxdc1Q99K01 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdxdc1Q99K01 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdxdc1Q99K01 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdxdc1Q99K01 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdxdc1Q99K01 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdxdc1Q99K01 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdxdc1Q99K01 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdxdc1Q99K01 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdxdc1Q99K01 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdxdc1Q99K01 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdxdc1Q99K01 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdxdc1Q99K01 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdxdc1Q99K01 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdxdc1Q99K01 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdxdc1Q99K01 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdxdc1Q99K01 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdxdc1Q99K01 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdxdc1Q99K01 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdxdc1Q99K01 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdxdc1Q99K01 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdxdc1Q99K01 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdxdc1Q99K01 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdxdc1Q99K01 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdxdc1Q99K01 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdxdc1Q99K01 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdxdc1Q99K01 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdxdc1Q99K01 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdxdc1Q99K01 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdxdc1Q99K01 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdxdc1Q99K01 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdxdc1Q99K01 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdxdc1Q99K01 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdxdc1Q99K01 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdxdc1Q99K01 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdxdc1Q99K01 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdxdc1Q99K01 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdxdc1Q99K01 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdxdc1Q99K01 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdxdc1Q99K01 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdxdc1Q99K01 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdxdc1Q99K01 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdxdc1Q99K01 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdxdc1Q99K01 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdxdc1Q99K01 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdxdc1Q99K01 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdxdc1Q99K01 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdxdc1Q99K01 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdxdc1Q99K01 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdxdc1Q99K01 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdxdc1Q99K01 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdxdc1Q99K01 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdxdc1Q99K01 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdxdc1Q99K01 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdxdc1Q99K01 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdxdc1Q99K01 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdxdc1Q99K01 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdxdc1Q99K01 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdxdc1Q99K01 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdxdc1Q99K01 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdxdc1Q99K01 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdxdc1Q99K01 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pdxdc1Q99K01 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pdxdc1Q99K01 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pdxdc1Q99K01 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pdxdc1Q99K01 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pdxdc1Q99K01 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Pdxdc1Q99K01 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms