Protein–RNA interactions for Protein: Q99J21

Mcoln1, Mucolipin-1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcoln1Q99J21 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mcoln1Q99J21 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mcoln1Q99J21 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mcoln1Q99J21 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mcoln1Q99J21 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mcoln1Q99J21 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mcoln1Q99J21 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mcoln1Q99J21 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mcoln1Q99J21 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mcoln1Q99J21 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mcoln1Q99J21 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mcoln1Q99J21 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Mcoln1Q99J21 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mcoln1Q99J21 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mcoln1Q99J21 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mcoln1Q99J21 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mcoln1Q99J21 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mcoln1Q99J21 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mcoln1Q99J21 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mcoln1Q99J21 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mcoln1Q99J21 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mcoln1Q99J21 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mcoln1Q99J21 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mcoln1Q99J21 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mcoln1Q99J21 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mcoln1Q99J21 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mcoln1Q99J21 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mcoln1Q99J21 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Mcoln1Q99J21 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mcoln1Q99J21 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mcoln1Q99J21 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mcoln1Q99J21 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Mcoln1Q99J21 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mcoln1Q99J21 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mcoln1Q99J21 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mcoln1Q99J21 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mcoln1Q99J21 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mcoln1Q99J21 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mcoln1Q99J21 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mcoln1Q99J21 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mcoln1Q99J21 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mcoln1Q99J21 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Mcoln1Q99J21 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mcoln1Q99J21 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mcoln1Q99J21 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mcoln1Q99J21 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mcoln1Q99J21 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mcoln1Q99J21 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mcoln1Q99J21 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mcoln1Q99J21 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mcoln1Q99J21 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mcoln1Q99J21 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mcoln1Q99J21 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mcoln1Q99J21 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mcoln1Q99J21 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mcoln1Q99J21 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mcoln1Q99J21 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mcoln1Q99J21 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mcoln1Q99J21 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mcoln1Q99J21 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mcoln1Q99J21 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mcoln1Q99J21 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mcoln1Q99J21 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mcoln1Q99J21 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mcoln1Q99J21 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mcoln1Q99J21 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mcoln1Q99J21 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mcoln1Q99J21 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mcoln1Q99J21 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mcoln1Q99J21 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mcoln1Q99J21 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mcoln1Q99J21 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mcoln1Q99J21 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mcoln1Q99J21 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Mcoln1Q99J21 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Mcoln1Q99J21 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mcoln1Q99J21 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mcoln1Q99J21 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mcoln1Q99J21 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mcoln1Q99J21 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mcoln1Q99J21 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mcoln1Q99J21 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mcoln1Q99J21 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Mcoln1Q99J21 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mcoln1Q99J21 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mcoln1Q99J21 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mcoln1Q99J21 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mcoln1Q99J21 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mcoln1Q99J21 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mcoln1Q99J21 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mcoln1Q99J21 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mcoln1Q99J21 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mcoln1Q99J21 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mcoln1Q99J21 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mcoln1Q99J21 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mcoln1Q99J21 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mcoln1Q99J21 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mcoln1Q99J21 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mcoln1Q99J21 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mcoln1Q99J21 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms