Protein–RNA interactions for Protein: Q99835

SMO, Smoothened homolog, humanhuman

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMOQ99835 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMOQ99835 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMOQ99835 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMOQ99835 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMOQ99835 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMOQ99835 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMOQ99835 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMOQ99835 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMOQ99835 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMOQ99835 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMOQ99835 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMOQ99835 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMOQ99835 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SMOQ99835 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SMOQ99835 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMOQ99835 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMOQ99835 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMOQ99835 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMOQ99835 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMOQ99835 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMOQ99835 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMOQ99835 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMOQ99835 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMOQ99835 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMOQ99835 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMOQ99835 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMOQ99835 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMOQ99835 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMOQ99835 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMOQ99835 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMOQ99835 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMOQ99835 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMOQ99835 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMOQ99835 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMOQ99835 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMOQ99835 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMOQ99835 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SMOQ99835 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMOQ99835 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMOQ99835 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMOQ99835 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMOQ99835 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMOQ99835 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMOQ99835 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMOQ99835 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SMOQ99835 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMOQ99835 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMOQ99835 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMOQ99835 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMOQ99835 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMOQ99835 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMOQ99835 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMOQ99835 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMOQ99835 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMOQ99835 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMOQ99835 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMOQ99835 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMOQ99835 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMOQ99835 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMOQ99835 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMOQ99835 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMOQ99835 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMOQ99835 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMOQ99835 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMOQ99835 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMOQ99835 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMOQ99835 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMOQ99835 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMOQ99835 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMOQ99835 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMOQ99835 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMOQ99835 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMOQ99835 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMOQ99835 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMOQ99835 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMOQ99835 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMOQ99835 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMOQ99835 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMOQ99835 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMOQ99835 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMOQ99835 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMOQ99835 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMOQ99835 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMOQ99835 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMOQ99835 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMOQ99835 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMOQ99835 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMOQ99835 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMOQ99835 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMOQ99835 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMOQ99835 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMOQ99835 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMOQ99835 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMOQ99835 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMOQ99835 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMOQ99835 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMOQ99835 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMOQ99835 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMOQ99835 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMOQ99835 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms