Protein–RNA interactions for Protein: Q99590

SCAF11, Protein SCAF11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF11Q99590 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
SCAF11Q99590 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
SCAF11Q99590 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
SCAF11Q99590 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
SCAF11Q99590 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
SCAF11Q99590 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC35.35■■■■□ 3.25
SCAF11Q99590 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
SCAF11Q99590 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
SCAF11Q99590 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
SCAF11Q99590 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
SCAF11Q99590 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
SCAF11Q99590 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
SCAF11Q99590 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
SCAF11Q99590 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
SCAF11Q99590 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
SCAF11Q99590 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
SCAF11Q99590 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
SCAF11Q99590 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
SCAF11Q99590 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
SCAF11Q99590 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
SCAF11Q99590 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
SCAF11Q99590 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
SCAF11Q99590 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
SCAF11Q99590 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
SCAF11Q99590 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
SCAF11Q99590 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
SCAF11Q99590 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
SCAF11Q99590 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC35.3■■■■□ 3.24
SCAF11Q99590 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
SCAF11Q99590 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SCAF11Q99590 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SCAF11Q99590 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
SCAF11Q99590 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SCAF11Q99590 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
SCAF11Q99590 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SCAF11Q99590 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SCAF11Q99590 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC35.27■■■■□ 3.24
SCAF11Q99590 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC35.27■■■■□ 3.24
SCAF11Q99590 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
SCAF11Q99590 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
SCAF11Q99590 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
SCAF11Q99590 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
SCAF11Q99590 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
SCAF11Q99590 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC35.26■■■■□ 3.23
SCAF11Q99590 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC35.26■■■■□ 3.23
SCAF11Q99590 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
SCAF11Q99590 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
SCAF11Q99590 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC35.25■■■■□ 3.23
SCAF11Q99590 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
SCAF11Q99590 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
SCAF11Q99590 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
SCAF11Q99590 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
SCAF11Q99590 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
SCAF11Q99590 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
SCAF11Q99590 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
SCAF11Q99590 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
SCAF11Q99590 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
SCAF11Q99590 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC35.23■■■■□ 3.23
SCAF11Q99590 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
SCAF11Q99590 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
SCAF11Q99590 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
SCAF11Q99590 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
SCAF11Q99590 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
SCAF11Q99590 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
SCAF11Q99590 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
SCAF11Q99590 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
SCAF11Q99590 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
SCAF11Q99590 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
SCAF11Q99590 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
SCAF11Q99590 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
SCAF11Q99590 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
SCAF11Q99590 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
SCAF11Q99590 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
SCAF11Q99590 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
SCAF11Q99590 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SCAF11Q99590 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SCAF11Q99590 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SCAF11Q99590 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC35.19■■■■□ 3.22
SCAF11Q99590 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
SCAF11Q99590 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
SCAF11Q99590 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
SCAF11Q99590 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SCAF11Q99590 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SCAF11Q99590 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
SCAF11Q99590 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
SCAF11Q99590 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SCAF11Q99590 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SCAF11Q99590 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SCAF11Q99590 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
SCAF11Q99590 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SCAF11Q99590 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SCAF11Q99590 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
SCAF11Q99590 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SCAF11Q99590 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SCAF11Q99590 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SCAF11Q99590 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
SCAF11Q99590 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
SCAF11Q99590 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC35.14■■■■□ 3.22
SCAF11Q99590 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SCAF11Q99590 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms