Protein–RNA interactions for Protein: Q99456

KRT12, Keratin, type I cytoskeletal 12, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT12Q99456 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT12Q99456 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT12Q99456 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT12Q99456 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT12Q99456 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT12Q99456 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT12Q99456 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT12Q99456 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT12Q99456 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT12Q99456 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT12Q99456 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT12Q99456 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT12Q99456 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT12Q99456 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT12Q99456 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT12Q99456 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT12Q99456 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT12Q99456 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT12Q99456 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT12Q99456 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT12Q99456 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT12Q99456 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT12Q99456 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT12Q99456 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT12Q99456 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT12Q99456 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT12Q99456 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT12Q99456 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT12Q99456 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT12Q99456 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KRT12Q99456 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KRT12Q99456 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KRT12Q99456 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT12Q99456 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT12Q99456 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT12Q99456 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT12Q99456 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT12Q99456 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT12Q99456 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT12Q99456 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT12Q99456 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT12Q99456 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT12Q99456 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT12Q99456 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT12Q99456 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT12Q99456 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT12Q99456 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT12Q99456 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT12Q99456 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT12Q99456 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT12Q99456 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT12Q99456 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT12Q99456 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT12Q99456 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT12Q99456 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT12Q99456 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT12Q99456 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT12Q99456 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT12Q99456 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT12Q99456 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT12Q99456 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT12Q99456 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT12Q99456 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT12Q99456 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT12Q99456 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT12Q99456 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT12Q99456 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT12Q99456 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT12Q99456 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT12Q99456 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT12Q99456 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT12Q99456 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT12Q99456 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT12Q99456 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT12Q99456 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT12Q99456 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT12Q99456 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT12Q99456 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT12Q99456 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT12Q99456 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT12Q99456 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT12Q99456 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT12Q99456 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT12Q99456 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT12Q99456 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT12Q99456 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT12Q99456 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT12Q99456 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT12Q99456 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT12Q99456 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT12Q99456 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT12Q99456 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT12Q99456 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT12Q99456 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT12Q99456 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT12Q99456 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT12Q99456 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT12Q99456 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT12Q99456 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT12Q99456 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms