Protein–RNA interactions for Protein: Q96T21

SECISBP2, Selenocysteine insertion sequence-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SECISBP2Q96T21 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SECISBP2Q96T21 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SECISBP2Q96T21 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SECISBP2Q96T21 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SECISBP2Q96T21 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SECISBP2Q96T21 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SECISBP2Q96T21 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SECISBP2Q96T21 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SECISBP2Q96T21 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SECISBP2Q96T21 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SECISBP2Q96T21 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SECISBP2Q96T21 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SECISBP2Q96T21 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SECISBP2Q96T21 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SECISBP2Q96T21 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SECISBP2Q96T21 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SECISBP2Q96T21 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SECISBP2Q96T21 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SECISBP2Q96T21 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SECISBP2Q96T21 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SECISBP2Q96T21 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SECISBP2Q96T21 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SECISBP2Q96T21 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SECISBP2Q96T21 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SECISBP2Q96T21 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SECISBP2Q96T21 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SECISBP2Q96T21 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SECISBP2Q96T21 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SECISBP2Q96T21 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SECISBP2Q96T21 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SECISBP2Q96T21 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SECISBP2Q96T21 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SECISBP2Q96T21 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SECISBP2Q96T21 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SECISBP2Q96T21 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SECISBP2Q96T21 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SECISBP2Q96T21 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SECISBP2Q96T21 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SECISBP2Q96T21 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SECISBP2Q96T21 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SECISBP2Q96T21 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SECISBP2Q96T21 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SECISBP2Q96T21 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SECISBP2Q96T21 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SECISBP2Q96T21 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SECISBP2Q96T21 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SECISBP2Q96T21 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SECISBP2Q96T21 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SECISBP2Q96T21 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SECISBP2Q96T21 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SECISBP2Q96T21 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SECISBP2Q96T21 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SECISBP2Q96T21 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SECISBP2Q96T21 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SECISBP2Q96T21 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SECISBP2Q96T21 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SECISBP2Q96T21 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SECISBP2Q96T21 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SECISBP2Q96T21 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SECISBP2Q96T21 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SECISBP2Q96T21 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SECISBP2Q96T21 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SECISBP2Q96T21 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SECISBP2Q96T21 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SECISBP2Q96T21 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SECISBP2Q96T21 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SECISBP2Q96T21 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SECISBP2Q96T21 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SECISBP2Q96T21 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SECISBP2Q96T21 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SECISBP2Q96T21 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SECISBP2Q96T21 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SECISBP2Q96T21 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SECISBP2Q96T21 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SECISBP2Q96T21 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SECISBP2Q96T21 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SECISBP2Q96T21 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SECISBP2Q96T21 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SECISBP2Q96T21 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SECISBP2Q96T21 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SECISBP2Q96T21 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SECISBP2Q96T21 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SECISBP2Q96T21 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SECISBP2Q96T21 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SECISBP2Q96T21 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SECISBP2Q96T21 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SECISBP2Q96T21 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SECISBP2Q96T21 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SECISBP2Q96T21 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SECISBP2Q96T21 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SECISBP2Q96T21 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SECISBP2Q96T21 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SECISBP2Q96T21 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SECISBP2Q96T21 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SECISBP2Q96T21 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SECISBP2Q96T21 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SECISBP2Q96T21 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SECISBP2Q96T21 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SECISBP2Q96T21 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SECISBP2Q96T21 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms