Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TSPAN18Q96SJ8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TSPAN18Q96SJ8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TSPAN18Q96SJ8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TSPAN18Q96SJ8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TSPAN18Q96SJ8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TSPAN18Q96SJ8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TSPAN18Q96SJ8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TSPAN18Q96SJ8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TSPAN18Q96SJ8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSPAN18Q96SJ8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSPAN18Q96SJ8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSPAN18Q96SJ8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSPAN18Q96SJ8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSPAN18Q96SJ8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSPAN18Q96SJ8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSPAN18Q96SJ8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSPAN18Q96SJ8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSPAN18Q96SJ8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSPAN18Q96SJ8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSPAN18Q96SJ8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSPAN18Q96SJ8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSPAN18Q96SJ8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TSPAN18Q96SJ8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TSPAN18Q96SJ8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
TSPAN18Q96SJ8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSPAN18Q96SJ8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSPAN18Q96SJ8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSPAN18Q96SJ8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSPAN18Q96SJ8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSPAN18Q96SJ8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSPAN18Q96SJ8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSPAN18Q96SJ8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSPAN18Q96SJ8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSPAN18Q96SJ8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSPAN18Q96SJ8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSPAN18Q96SJ8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSPAN18Q96SJ8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TSPAN18Q96SJ8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSPAN18Q96SJ8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSPAN18Q96SJ8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSPAN18Q96SJ8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSPAN18Q96SJ8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSPAN18Q96SJ8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSPAN18Q96SJ8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSPAN18Q96SJ8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSPAN18Q96SJ8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSPAN18Q96SJ8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSPAN18Q96SJ8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSPAN18Q96SJ8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TSPAN18Q96SJ8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSPAN18Q96SJ8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSPAN18Q96SJ8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSPAN18Q96SJ8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSPAN18Q96SJ8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSPAN18Q96SJ8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TSPAN18Q96SJ8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TSPAN18Q96SJ8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSPAN18Q96SJ8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSPAN18Q96SJ8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSPAN18Q96SJ8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSPAN18Q96SJ8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSPAN18Q96SJ8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSPAN18Q96SJ8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSPAN18Q96SJ8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TSPAN18Q96SJ8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TSPAN18Q96SJ8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TSPAN18Q96SJ8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TSPAN18Q96SJ8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TSPAN18Q96SJ8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TSPAN18Q96SJ8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TSPAN18Q96SJ8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TSPAN18Q96SJ8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TSPAN18Q96SJ8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TSPAN18Q96SJ8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TSPAN18Q96SJ8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TSPAN18Q96SJ8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TSPAN18Q96SJ8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TSPAN18Q96SJ8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TSPAN18Q96SJ8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TSPAN18Q96SJ8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TSPAN18Q96SJ8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TSPAN18Q96SJ8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TSPAN18Q96SJ8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TSPAN18Q96SJ8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TSPAN18Q96SJ8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TSPAN18Q96SJ8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TSPAN18Q96SJ8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TSPAN18Q96SJ8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TSPAN18Q96SJ8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TSPAN18Q96SJ8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TSPAN18Q96SJ8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TSPAN18Q96SJ8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TSPAN18Q96SJ8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TSPAN18Q96SJ8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TSPAN18Q96SJ8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TSPAN18Q96SJ8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TSPAN18Q96SJ8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TSPAN18Q96SJ8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TSPAN18Q96SJ8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms