Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT1

ERBIN, Erbin, humanhuman

Predictions only

Length 1,412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBINQ96RT1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
ERBINQ96RT1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
ERBINQ96RT1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
ERBINQ96RT1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
ERBINQ96RT1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
ERBINQ96RT1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
ERBINQ96RT1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
ERBINQ96RT1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
ERBINQ96RT1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
ERBINQ96RT1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
ERBINQ96RT1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
ERBINQ96RT1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ERBINQ96RT1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
ERBINQ96RT1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
ERBINQ96RT1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
ERBINQ96RT1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
ERBINQ96RT1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
ERBINQ96RT1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
ERBINQ96RT1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
ERBINQ96RT1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
ERBINQ96RT1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
ERBINQ96RT1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
ERBINQ96RT1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
ERBINQ96RT1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
ERBINQ96RT1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
ERBINQ96RT1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
ERBINQ96RT1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
ERBINQ96RT1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
ERBINQ96RT1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
ERBINQ96RT1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
ERBINQ96RT1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
ERBINQ96RT1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
ERBINQ96RT1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
ERBINQ96RT1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
ERBINQ96RT1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ERBINQ96RT1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ERBINQ96RT1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ERBINQ96RT1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ERBINQ96RT1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ERBINQ96RT1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ERBINQ96RT1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ERBINQ96RT1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ERBINQ96RT1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ERBINQ96RT1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
ERBINQ96RT1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ERBINQ96RT1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC36.16■■■■□ 3.38
ERBINQ96RT1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
ERBINQ96RT1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
ERBINQ96RT1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
ERBINQ96RT1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
ERBINQ96RT1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
ERBINQ96RT1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
ERBINQ96RT1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
ERBINQ96RT1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
ERBINQ96RT1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
ERBINQ96RT1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
ERBINQ96RT1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
ERBINQ96RT1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
ERBINQ96RT1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
ERBINQ96RT1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
ERBINQ96RT1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
ERBINQ96RT1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
ERBINQ96RT1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
ERBINQ96RT1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
ERBINQ96RT1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
ERBINQ96RT1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
ERBINQ96RT1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
ERBINQ96RT1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
ERBINQ96RT1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
ERBINQ96RT1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
ERBINQ96RT1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
ERBINQ96RT1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
ERBINQ96RT1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
ERBINQ96RT1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
ERBINQ96RT1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
ERBINQ96RT1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
ERBINQ96RT1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
ERBINQ96RT1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
ERBINQ96RT1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
ERBINQ96RT1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
ERBINQ96RT1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
ERBINQ96RT1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
ERBINQ96RT1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
ERBINQ96RT1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
ERBINQ96RT1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC36.05■■■■□ 3.36
ERBINQ96RT1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC36.05■■■■□ 3.36
ERBINQ96RT1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
ERBINQ96RT1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
ERBINQ96RT1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
ERBINQ96RT1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC36.04■■■■□ 3.36
ERBINQ96RT1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
ERBINQ96RT1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ERBINQ96RT1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ERBINQ96RT1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
ERBINQ96RT1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
ERBINQ96RT1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
ERBINQ96RT1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
ERBINQ96RT1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
ERBINQ96RT1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC36.01■■■■□ 3.35
ERBINQ96RT1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC36.01■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms