Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q11

TRNT1, CCA tRNA nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 434 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNT1Q96Q11 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRNT1Q96Q11 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRNT1Q96Q11 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRNT1Q96Q11 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRNT1Q96Q11 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRNT1Q96Q11 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRNT1Q96Q11 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRNT1Q96Q11 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRNT1Q96Q11 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRNT1Q96Q11 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRNT1Q96Q11 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRNT1Q96Q11 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRNT1Q96Q11 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRNT1Q96Q11 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRNT1Q96Q11 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRNT1Q96Q11 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRNT1Q96Q11 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRNT1Q96Q11 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRNT1Q96Q11 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRNT1Q96Q11 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRNT1Q96Q11 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRNT1Q96Q11 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRNT1Q96Q11 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRNT1Q96Q11 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRNT1Q96Q11 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRNT1Q96Q11 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRNT1Q96Q11 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRNT1Q96Q11 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRNT1Q96Q11 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRNT1Q96Q11 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRNT1Q96Q11 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRNT1Q96Q11 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRNT1Q96Q11 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRNT1Q96Q11 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRNT1Q96Q11 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRNT1Q96Q11 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRNT1Q96Q11 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRNT1Q96Q11 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRNT1Q96Q11 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRNT1Q96Q11 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRNT1Q96Q11 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRNT1Q96Q11 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRNT1Q96Q11 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRNT1Q96Q11 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRNT1Q96Q11 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRNT1Q96Q11 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRNT1Q96Q11 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRNT1Q96Q11 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRNT1Q96Q11 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRNT1Q96Q11 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRNT1Q96Q11 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TRNT1Q96Q11 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRNT1Q96Q11 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRNT1Q96Q11 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRNT1Q96Q11 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRNT1Q96Q11 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRNT1Q96Q11 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRNT1Q96Q11 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRNT1Q96Q11 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRNT1Q96Q11 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRNT1Q96Q11 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRNT1Q96Q11 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRNT1Q96Q11 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRNT1Q96Q11 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRNT1Q96Q11 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRNT1Q96Q11 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRNT1Q96Q11 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRNT1Q96Q11 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRNT1Q96Q11 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRNT1Q96Q11 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRNT1Q96Q11 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRNT1Q96Q11 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRNT1Q96Q11 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRNT1Q96Q11 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRNT1Q96Q11 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRNT1Q96Q11 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRNT1Q96Q11 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRNT1Q96Q11 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRNT1Q96Q11 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRNT1Q96Q11 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRNT1Q96Q11 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRNT1Q96Q11 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRNT1Q96Q11 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRNT1Q96Q11 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRNT1Q96Q11 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRNT1Q96Q11 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRNT1Q96Q11 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRNT1Q96Q11 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRNT1Q96Q11 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRNT1Q96Q11 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRNT1Q96Q11 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRNT1Q96Q11 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRNT1Q96Q11 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRNT1Q96Q11 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRNT1Q96Q11 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRNT1Q96Q11 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRNT1Q96Q11 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRNT1Q96Q11 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRNT1Q96Q11 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRNT1Q96Q11 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
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