Protein–RNA interactions for Protein: Q96N53

LINC00167, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00167, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00167Q96N53 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00167Q96N53 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00167Q96N53 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00167Q96N53 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00167Q96N53 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00167Q96N53 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00167Q96N53 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00167Q96N53 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00167Q96N53 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00167Q96N53 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00167Q96N53 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00167Q96N53 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00167Q96N53 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00167Q96N53 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00167Q96N53 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00167Q96N53 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00167Q96N53 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00167Q96N53 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00167Q96N53 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00167Q96N53 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00167Q96N53 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms