Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00208Q96KT6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00208Q96KT6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LINC00208Q96KT6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LINC00208Q96KT6 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LINC00208Q96KT6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LINC00208Q96KT6 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LINC00208Q96KT6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LINC00208Q96KT6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
LINC00208Q96KT6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LINC00208Q96KT6 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
LINC00208Q96KT6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LINC00208Q96KT6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
LINC00208Q96KT6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LINC00208Q96KT6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LINC00208Q96KT6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LINC00208Q96KT6 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LINC00208Q96KT6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LINC00208Q96KT6 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LINC00208Q96KT6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LINC00208Q96KT6 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LINC00208Q96KT6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LINC00208Q96KT6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LINC00208Q96KT6 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LINC00208Q96KT6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LINC00208Q96KT6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LINC00208Q96KT6 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LINC00208Q96KT6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00208Q96KT6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00208Q96KT6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00208Q96KT6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00208Q96KT6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00208Q96KT6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00208Q96KT6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00208Q96KT6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00208Q96KT6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00208Q96KT6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00208Q96KT6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00208Q96KT6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00208Q96KT6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00208Q96KT6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
LINC00208Q96KT6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00208Q96KT6 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00208Q96KT6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00208Q96KT6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00208Q96KT6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00208Q96KT6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00208Q96KT6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00208Q96KT6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00208Q96KT6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00208Q96KT6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00208Q96KT6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00208Q96KT6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00208Q96KT6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00208Q96KT6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00208Q96KT6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00208Q96KT6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00208Q96KT6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00208Q96KT6 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00208Q96KT6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00208Q96KT6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00208Q96KT6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00208Q96KT6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00208Q96KT6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00208Q96KT6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00208Q96KT6 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00208Q96KT6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00208Q96KT6 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00208Q96KT6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00208Q96KT6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00208Q96KT6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00208Q96KT6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00208Q96KT6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00208Q96KT6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00208Q96KT6 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00208Q96KT6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00208Q96KT6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00208Q96KT6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00208Q96KT6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00208Q96KT6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00208Q96KT6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00208Q96KT6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00208Q96KT6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00208Q96KT6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00208Q96KT6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00208Q96KT6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00208Q96KT6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00208Q96KT6 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00208Q96KT6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00208Q96KT6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00208Q96KT6 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00208Q96KT6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00208Q96KT6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00208Q96KT6 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00208Q96KT6 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00208Q96KT6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00208Q96KT6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00208Q96KT6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00208Q96KT6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00208Q96KT6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.9 ms