Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CCDC136Q96JN2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CCDC136Q96JN2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CCDC136Q96JN2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CCDC136Q96JN2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CCDC136Q96JN2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CCDC136Q96JN2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CCDC136Q96JN2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CCDC136Q96JN2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CCDC136Q96JN2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CCDC136Q96JN2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CCDC136Q96JN2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
CCDC136Q96JN2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CCDC136Q96JN2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CCDC136Q96JN2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CCDC136Q96JN2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CCDC136Q96JN2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CCDC136Q96JN2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CCDC136Q96JN2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CCDC136Q96JN2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CCDC136Q96JN2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC136Q96JN2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC136Q96JN2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC136Q96JN2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC136Q96JN2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC136Q96JN2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
CCDC136Q96JN2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
CCDC136Q96JN2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
CCDC136Q96JN2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
CCDC136Q96JN2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CCDC136Q96JN2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CCDC136Q96JN2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CCDC136Q96JN2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CCDC136Q96JN2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CCDC136Q96JN2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CCDC136Q96JN2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CCDC136Q96JN2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CCDC136Q96JN2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
CCDC136Q96JN2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CCDC136Q96JN2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC136Q96JN2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC136Q96JN2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC136Q96JN2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC136Q96JN2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC136Q96JN2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC136Q96JN2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC136Q96JN2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC136Q96JN2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC136Q96JN2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC136Q96JN2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC136Q96JN2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC136Q96JN2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC136Q96JN2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC136Q96JN2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC136Q96JN2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CCDC136Q96JN2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CCDC136Q96JN2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CCDC136Q96JN2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CCDC136Q96JN2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CCDC136Q96JN2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CCDC136Q96JN2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CCDC136Q96JN2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CCDC136Q96JN2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CCDC136Q96JN2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CCDC136Q96JN2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CCDC136Q96JN2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CCDC136Q96JN2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CCDC136Q96JN2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CCDC136Q96JN2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CCDC136Q96JN2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CCDC136Q96JN2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CCDC136Q96JN2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CCDC136Q96JN2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CCDC136Q96JN2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CCDC136Q96JN2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CCDC136Q96JN2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CCDC136Q96JN2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CCDC136Q96JN2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CCDC136Q96JN2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CCDC136Q96JN2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CCDC136Q96JN2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CCDC136Q96JN2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CCDC136Q96JN2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CCDC136Q96JN2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CCDC136Q96JN2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CCDC136Q96JN2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CCDC136Q96JN2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CCDC136Q96JN2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
CCDC136Q96JN2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CCDC136Q96JN2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CCDC136Q96JN2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CCDC136Q96JN2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CCDC136Q96JN2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CCDC136Q96JN2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CCDC136Q96JN2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CCDC136Q96JN2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CCDC136Q96JN2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CCDC136Q96JN2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
CCDC136Q96JN2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CCDC136Q96JN2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms