Protein–RNA interactions for Protein: Q96GJ1

TRMT2B, tRNA (uracil(54)-C(5))-methyltransferase homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT2BQ96GJ1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRMT2BQ96GJ1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRMT2BQ96GJ1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRMT2BQ96GJ1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRMT2BQ96GJ1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRMT2BQ96GJ1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRMT2BQ96GJ1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRMT2BQ96GJ1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRMT2BQ96GJ1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TRMT2BQ96GJ1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TRMT2BQ96GJ1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRMT2BQ96GJ1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TRMT2BQ96GJ1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRMT2BQ96GJ1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRMT2BQ96GJ1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRMT2BQ96GJ1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRMT2BQ96GJ1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRMT2BQ96GJ1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRMT2BQ96GJ1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TRMT2BQ96GJ1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRMT2BQ96GJ1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRMT2BQ96GJ1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRMT2BQ96GJ1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRMT2BQ96GJ1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRMT2BQ96GJ1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRMT2BQ96GJ1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TRMT2BQ96GJ1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRMT2BQ96GJ1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRMT2BQ96GJ1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRMT2BQ96GJ1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TRMT2BQ96GJ1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRMT2BQ96GJ1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRMT2BQ96GJ1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TRMT2BQ96GJ1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRMT2BQ96GJ1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRMT2BQ96GJ1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TRMT2BQ96GJ1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRMT2BQ96GJ1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRMT2BQ96GJ1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRMT2BQ96GJ1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRMT2BQ96GJ1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRMT2BQ96GJ1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRMT2BQ96GJ1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRMT2BQ96GJ1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRMT2BQ96GJ1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRMT2BQ96GJ1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TRMT2BQ96GJ1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRMT2BQ96GJ1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRMT2BQ96GJ1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRMT2BQ96GJ1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRMT2BQ96GJ1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRMT2BQ96GJ1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRMT2BQ96GJ1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRMT2BQ96GJ1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRMT2BQ96GJ1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRMT2BQ96GJ1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRMT2BQ96GJ1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRMT2BQ96GJ1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRMT2BQ96GJ1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TRMT2BQ96GJ1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRMT2BQ96GJ1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRMT2BQ96GJ1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRMT2BQ96GJ1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRMT2BQ96GJ1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRMT2BQ96GJ1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRMT2BQ96GJ1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRMT2BQ96GJ1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRMT2BQ96GJ1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRMT2BQ96GJ1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRMT2BQ96GJ1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRMT2BQ96GJ1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRMT2BQ96GJ1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRMT2BQ96GJ1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRMT2BQ96GJ1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRMT2BQ96GJ1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRMT2BQ96GJ1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRMT2BQ96GJ1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRMT2BQ96GJ1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRMT2BQ96GJ1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRMT2BQ96GJ1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRMT2BQ96GJ1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRMT2BQ96GJ1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TRMT2BQ96GJ1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRMT2BQ96GJ1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRMT2BQ96GJ1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRMT2BQ96GJ1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRMT2BQ96GJ1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRMT2BQ96GJ1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRMT2BQ96GJ1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRMT2BQ96GJ1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRMT2BQ96GJ1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRMT2BQ96GJ1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRMT2BQ96GJ1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRMT2BQ96GJ1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRMT2BQ96GJ1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRMT2BQ96GJ1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRMT2BQ96GJ1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRMT2BQ96GJ1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRMT2BQ96GJ1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRMT2BQ96GJ1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms