Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCMH1Q96GD3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCMH1Q96GD3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCMH1Q96GD3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCMH1Q96GD3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCMH1Q96GD3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCMH1Q96GD3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SCMH1Q96GD3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCMH1Q96GD3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCMH1Q96GD3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCMH1Q96GD3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCMH1Q96GD3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SCMH1Q96GD3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCMH1Q96GD3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCMH1Q96GD3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCMH1Q96GD3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCMH1Q96GD3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCMH1Q96GD3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCMH1Q96GD3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCMH1Q96GD3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCMH1Q96GD3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCMH1Q96GD3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCMH1Q96GD3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCMH1Q96GD3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCMH1Q96GD3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCMH1Q96GD3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCMH1Q96GD3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCMH1Q96GD3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCMH1Q96GD3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCMH1Q96GD3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCMH1Q96GD3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCMH1Q96GD3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCMH1Q96GD3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCMH1Q96GD3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SCMH1Q96GD3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCMH1Q96GD3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCMH1Q96GD3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SCMH1Q96GD3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SCMH1Q96GD3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCMH1Q96GD3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCMH1Q96GD3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCMH1Q96GD3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCMH1Q96GD3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCMH1Q96GD3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCMH1Q96GD3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCMH1Q96GD3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCMH1Q96GD3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCMH1Q96GD3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCMH1Q96GD3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCMH1Q96GD3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCMH1Q96GD3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCMH1Q96GD3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCMH1Q96GD3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCMH1Q96GD3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCMH1Q96GD3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCMH1Q96GD3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCMH1Q96GD3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCMH1Q96GD3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCMH1Q96GD3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCMH1Q96GD3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCMH1Q96GD3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCMH1Q96GD3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCMH1Q96GD3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCMH1Q96GD3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCMH1Q96GD3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCMH1Q96GD3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCMH1Q96GD3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCMH1Q96GD3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCMH1Q96GD3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCMH1Q96GD3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCMH1Q96GD3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCMH1Q96GD3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCMH1Q96GD3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCMH1Q96GD3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCMH1Q96GD3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCMH1Q96GD3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCMH1Q96GD3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCMH1Q96GD3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCMH1Q96GD3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCMH1Q96GD3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCMH1Q96GD3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCMH1Q96GD3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCMH1Q96GD3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCMH1Q96GD3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCMH1Q96GD3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCMH1Q96GD3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCMH1Q96GD3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCMH1Q96GD3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCMH1Q96GD3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCMH1Q96GD3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCMH1Q96GD3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCMH1Q96GD3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SCMH1Q96GD3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCMH1Q96GD3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCMH1Q96GD3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCMH1Q96GD3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCMH1Q96GD3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCMH1Q96GD3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCMH1Q96GD3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCMH1Q96GD3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms