Protein–RNA interactions for Protein: Q96G79

SLC35A4, Probable UDP-sugar transporter protein SLC35A4, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A4Q96G79 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC35A4Q96G79 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC35A4Q96G79 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC35A4Q96G79 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC35A4Q96G79 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC35A4Q96G79 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC35A4Q96G79 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC35A4Q96G79 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC35A4Q96G79 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC35A4Q96G79 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC35A4Q96G79 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC35A4Q96G79 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC35A4Q96G79 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC35A4Q96G79 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC35A4Q96G79 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC35A4Q96G79 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC35A4Q96G79 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC35A4Q96G79 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC35A4Q96G79 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC35A4Q96G79 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC35A4Q96G79 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC35A4Q96G79 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC35A4Q96G79 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC35A4Q96G79 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC35A4Q96G79 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC35A4Q96G79 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC35A4Q96G79 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC35A4Q96G79 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC35A4Q96G79 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC35A4Q96G79 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC35A4Q96G79 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC35A4Q96G79 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC35A4Q96G79 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC35A4Q96G79 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC35A4Q96G79 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC35A4Q96G79 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC35A4Q96G79 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC35A4Q96G79 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC35A4Q96G79 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC35A4Q96G79 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC35A4Q96G79 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC35A4Q96G79 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC35A4Q96G79 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC35A4Q96G79 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC35A4Q96G79 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC35A4Q96G79 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC35A4Q96G79 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC35A4Q96G79 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC35A4Q96G79 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC35A4Q96G79 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC35A4Q96G79 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC35A4Q96G79 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC35A4Q96G79 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SLC35A4Q96G79 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC35A4Q96G79 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC35A4Q96G79 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC35A4Q96G79 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC35A4Q96G79 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC35A4Q96G79 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC35A4Q96G79 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC35A4Q96G79 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC35A4Q96G79 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC35A4Q96G79 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC35A4Q96G79 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC35A4Q96G79 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC35A4Q96G79 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC35A4Q96G79 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC35A4Q96G79 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC35A4Q96G79 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC35A4Q96G79 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC35A4Q96G79 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC35A4Q96G79 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC35A4Q96G79 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC35A4Q96G79 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC35A4Q96G79 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC35A4Q96G79 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC35A4Q96G79 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC35A4Q96G79 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC35A4Q96G79 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC35A4Q96G79 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC35A4Q96G79 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC35A4Q96G79 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC35A4Q96G79 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC35A4Q96G79 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC35A4Q96G79 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC35A4Q96G79 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC35A4Q96G79 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC35A4Q96G79 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC35A4Q96G79 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC35A4Q96G79 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC35A4Q96G79 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC35A4Q96G79 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC35A4Q96G79 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC35A4Q96G79 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC35A4Q96G79 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC35A4Q96G79 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC35A4Q96G79 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC35A4Q96G79 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC35A4Q96G79 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC35A4Q96G79 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms