Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
EDC3Q96F86 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
EDC3Q96F86 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
EDC3Q96F86 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
EDC3Q96F86 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
EDC3Q96F86 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
EDC3Q96F86 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
EDC3Q96F86 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
EDC3Q96F86 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
EDC3Q96F86 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
EDC3Q96F86 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
EDC3Q96F86 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
EDC3Q96F86 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
EDC3Q96F86 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
EDC3Q96F86 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
EDC3Q96F86 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
EDC3Q96F86 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
EDC3Q96F86 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
EDC3Q96F86 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
EDC3Q96F86 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
EDC3Q96F86 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
EDC3Q96F86 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
EDC3Q96F86 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
EDC3Q96F86 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
EDC3Q96F86 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
EDC3Q96F86 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
EDC3Q96F86 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
EDC3Q96F86 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
EDC3Q96F86 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
EDC3Q96F86 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
EDC3Q96F86 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
EDC3Q96F86 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
EDC3Q96F86 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
EDC3Q96F86 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
EDC3Q96F86 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
EDC3Q96F86 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
EDC3Q96F86 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
EDC3Q96F86 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
EDC3Q96F86 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
EDC3Q96F86 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
EDC3Q96F86 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
EDC3Q96F86 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
EDC3Q96F86 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
EDC3Q96F86 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
EDC3Q96F86 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
EDC3Q96F86 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
EDC3Q96F86 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
EDC3Q96F86 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
EDC3Q96F86 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
EDC3Q96F86 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
EDC3Q96F86 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
EDC3Q96F86 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
EDC3Q96F86 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
EDC3Q96F86 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
EDC3Q96F86 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
EDC3Q96F86 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
EDC3Q96F86 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
EDC3Q96F86 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
EDC3Q96F86 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
EDC3Q96F86 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
EDC3Q96F86 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
EDC3Q96F86 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
EDC3Q96F86 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
EDC3Q96F86 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
EDC3Q96F86 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
EDC3Q96F86 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
EDC3Q96F86 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
EDC3Q96F86 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
EDC3Q96F86 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
EDC3Q96F86 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
EDC3Q96F86 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
EDC3Q96F86 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
EDC3Q96F86 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
EDC3Q96F86 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
EDC3Q96F86 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
EDC3Q96F86 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
EDC3Q96F86 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
EDC3Q96F86 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
EDC3Q96F86 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
EDC3Q96F86 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
EDC3Q96F86 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
EDC3Q96F86 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
EDC3Q96F86 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
EDC3Q96F86 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
EDC3Q96F86 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
EDC3Q96F86 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
EDC3Q96F86 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
EDC3Q96F86 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
EDC3Q96F86 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
EDC3Q96F86 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
EDC3Q96F86 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
EDC3Q96F86 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
EDC3Q96F86 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
EDC3Q96F86 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
EDC3Q96F86 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
EDC3Q96F86 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
EDC3Q96F86 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
EDC3Q96F86 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
EDC3Q96F86 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
EDC3Q96F86 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms