Protein–RNA interactions for Protein: Q96EA4

SPDL1, Protein Spindly, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDL1Q96EA4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPDL1Q96EA4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPDL1Q96EA4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPDL1Q96EA4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPDL1Q96EA4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPDL1Q96EA4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPDL1Q96EA4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPDL1Q96EA4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPDL1Q96EA4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SPDL1Q96EA4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPDL1Q96EA4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPDL1Q96EA4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPDL1Q96EA4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPDL1Q96EA4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPDL1Q96EA4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPDL1Q96EA4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPDL1Q96EA4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPDL1Q96EA4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPDL1Q96EA4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPDL1Q96EA4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPDL1Q96EA4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPDL1Q96EA4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPDL1Q96EA4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPDL1Q96EA4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPDL1Q96EA4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPDL1Q96EA4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPDL1Q96EA4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPDL1Q96EA4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPDL1Q96EA4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPDL1Q96EA4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPDL1Q96EA4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPDL1Q96EA4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPDL1Q96EA4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPDL1Q96EA4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPDL1Q96EA4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPDL1Q96EA4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPDL1Q96EA4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPDL1Q96EA4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPDL1Q96EA4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPDL1Q96EA4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPDL1Q96EA4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPDL1Q96EA4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPDL1Q96EA4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPDL1Q96EA4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPDL1Q96EA4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPDL1Q96EA4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SPDL1Q96EA4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SPDL1Q96EA4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPDL1Q96EA4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPDL1Q96EA4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPDL1Q96EA4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPDL1Q96EA4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPDL1Q96EA4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPDL1Q96EA4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPDL1Q96EA4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPDL1Q96EA4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPDL1Q96EA4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPDL1Q96EA4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPDL1Q96EA4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPDL1Q96EA4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPDL1Q96EA4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPDL1Q96EA4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPDL1Q96EA4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SPDL1Q96EA4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPDL1Q96EA4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPDL1Q96EA4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPDL1Q96EA4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPDL1Q96EA4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPDL1Q96EA4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPDL1Q96EA4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPDL1Q96EA4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPDL1Q96EA4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPDL1Q96EA4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPDL1Q96EA4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPDL1Q96EA4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPDL1Q96EA4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPDL1Q96EA4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPDL1Q96EA4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPDL1Q96EA4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPDL1Q96EA4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPDL1Q96EA4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPDL1Q96EA4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
SPDL1Q96EA4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPDL1Q96EA4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPDL1Q96EA4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPDL1Q96EA4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPDL1Q96EA4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPDL1Q96EA4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPDL1Q96EA4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPDL1Q96EA4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPDL1Q96EA4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPDL1Q96EA4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPDL1Q96EA4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPDL1Q96EA4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPDL1Q96EA4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPDL1Q96EA4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPDL1Q96EA4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPDL1Q96EA4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPDL1Q96EA4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPDL1Q96EA4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms