Protein–RNA interactions for Protein: Q96DA2

RAB39B, Ras-related protein Rab-39B, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39BQ96DA2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB39BQ96DA2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB39BQ96DA2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB39BQ96DA2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB39BQ96DA2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB39BQ96DA2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB39BQ96DA2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB39BQ96DA2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB39BQ96DA2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB39BQ96DA2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB39BQ96DA2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB39BQ96DA2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB39BQ96DA2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB39BQ96DA2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB39BQ96DA2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB39BQ96DA2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB39BQ96DA2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB39BQ96DA2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB39BQ96DA2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB39BQ96DA2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB39BQ96DA2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RAB39BQ96DA2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
RAB39BQ96DA2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
RAB39BQ96DA2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB39BQ96DA2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB39BQ96DA2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB39BQ96DA2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB39BQ96DA2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB39BQ96DA2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB39BQ96DA2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB39BQ96DA2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB39BQ96DA2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB39BQ96DA2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB39BQ96DA2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB39BQ96DA2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB39BQ96DA2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB39BQ96DA2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB39BQ96DA2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB39BQ96DA2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB39BQ96DA2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB39BQ96DA2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB39BQ96DA2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB39BQ96DA2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB39BQ96DA2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB39BQ96DA2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB39BQ96DA2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB39BQ96DA2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB39BQ96DA2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB39BQ96DA2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB39BQ96DA2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB39BQ96DA2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB39BQ96DA2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB39BQ96DA2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB39BQ96DA2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB39BQ96DA2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB39BQ96DA2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB39BQ96DA2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB39BQ96DA2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB39BQ96DA2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB39BQ96DA2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB39BQ96DA2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB39BQ96DA2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB39BQ96DA2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB39BQ96DA2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB39BQ96DA2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB39BQ96DA2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB39BQ96DA2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB39BQ96DA2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB39BQ96DA2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB39BQ96DA2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB39BQ96DA2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB39BQ96DA2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB39BQ96DA2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB39BQ96DA2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB39BQ96DA2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB39BQ96DA2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB39BQ96DA2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB39BQ96DA2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB39BQ96DA2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB39BQ96DA2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB39BQ96DA2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
RAB39BQ96DA2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB39BQ96DA2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB39BQ96DA2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB39BQ96DA2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB39BQ96DA2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB39BQ96DA2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB39BQ96DA2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB39BQ96DA2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB39BQ96DA2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB39BQ96DA2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB39BQ96DA2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB39BQ96DA2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB39BQ96DA2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB39BQ96DA2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB39BQ96DA2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB39BQ96DA2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB39BQ96DA2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB39BQ96DA2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB39BQ96DA2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms