Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM4SF18Q96CE8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM4SF18Q96CE8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM4SF18Q96CE8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM4SF18Q96CE8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM4SF18Q96CE8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM4SF18Q96CE8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM4SF18Q96CE8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM4SF18Q96CE8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM4SF18Q96CE8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM4SF18Q96CE8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM4SF18Q96CE8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM4SF18Q96CE8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM4SF18Q96CE8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM4SF18Q96CE8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM4SF18Q96CE8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM4SF18Q96CE8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM4SF18Q96CE8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TM4SF18Q96CE8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM4SF18Q96CE8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM4SF18Q96CE8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM4SF18Q96CE8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM4SF18Q96CE8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM4SF18Q96CE8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM4SF18Q96CE8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM4SF18Q96CE8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM4SF18Q96CE8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TM4SF18Q96CE8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TM4SF18Q96CE8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM4SF18Q96CE8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM4SF18Q96CE8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM4SF18Q96CE8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM4SF18Q96CE8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM4SF18Q96CE8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM4SF18Q96CE8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM4SF18Q96CE8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM4SF18Q96CE8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM4SF18Q96CE8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TM4SF18Q96CE8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM4SF18Q96CE8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM4SF18Q96CE8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM4SF18Q96CE8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM4SF18Q96CE8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM4SF18Q96CE8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM4SF18Q96CE8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TM4SF18Q96CE8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TM4SF18Q96CE8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TM4SF18Q96CE8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TM4SF18Q96CE8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM4SF18Q96CE8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM4SF18Q96CE8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM4SF18Q96CE8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM4SF18Q96CE8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM4SF18Q96CE8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM4SF18Q96CE8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM4SF18Q96CE8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM4SF18Q96CE8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TM4SF18Q96CE8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM4SF18Q96CE8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM4SF18Q96CE8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM4SF18Q96CE8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM4SF18Q96CE8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM4SF18Q96CE8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM4SF18Q96CE8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM4SF18Q96CE8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TM4SF18Q96CE8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM4SF18Q96CE8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM4SF18Q96CE8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM4SF18Q96CE8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM4SF18Q96CE8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM4SF18Q96CE8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM4SF18Q96CE8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM4SF18Q96CE8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TM4SF18Q96CE8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM4SF18Q96CE8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM4SF18Q96CE8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM4SF18Q96CE8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM4SF18Q96CE8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM4SF18Q96CE8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM4SF18Q96CE8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TM4SF18Q96CE8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TM4SF18Q96CE8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TM4SF18Q96CE8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TM4SF18Q96CE8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TM4SF18Q96CE8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TM4SF18Q96CE8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM4SF18Q96CE8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM4SF18Q96CE8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM4SF18Q96CE8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM4SF18Q96CE8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM4SF18Q96CE8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM4SF18Q96CE8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TM4SF18Q96CE8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM4SF18Q96CE8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM4SF18Q96CE8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM4SF18Q96CE8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TM4SF18Q96CE8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM4SF18Q96CE8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM4SF18Q96CE8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM4SF18Q96CE8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms