Protein–RNA interactions for Protein: Q96C24

SYTL4, Synaptotagmin-like protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL4Q96C24 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
SYTL4Q96C24 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
SYTL4Q96C24 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
SYTL4Q96C24 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC31.8■■■□□ 2.68
SYTL4Q96C24 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
SYTL4Q96C24 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
SYTL4Q96C24 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
SYTL4Q96C24 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
SYTL4Q96C24 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
SYTL4Q96C24 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
SYTL4Q96C24 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
SYTL4Q96C24 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
SYTL4Q96C24 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
SYTL4Q96C24 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
SYTL4Q96C24 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
SYTL4Q96C24 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
SYTL4Q96C24 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
SYTL4Q96C24 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
SYTL4Q96C24 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
SYTL4Q96C24 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SYTL4Q96C24 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
SYTL4Q96C24 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC31.76■■■□□ 2.68
SYTL4Q96C24 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
SYTL4Q96C24 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
SYTL4Q96C24 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
SYTL4Q96C24 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
SYTL4Q96C24 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
SYTL4Q96C24 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SYTL4Q96C24 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SYTL4Q96C24 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SYTL4Q96C24 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SYTL4Q96C24 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SYTL4Q96C24 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
SYTL4Q96C24 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
SYTL4Q96C24 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SYTL4Q96C24 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
SYTL4Q96C24 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SYTL4Q96C24 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
SYTL4Q96C24 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SYTL4Q96C24 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
SYTL4Q96C24 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
SYTL4Q96C24 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
SYTL4Q96C24 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
SYTL4Q96C24 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
SYTL4Q96C24 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SYTL4Q96C24 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SYTL4Q96C24 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
SYTL4Q96C24 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SYTL4Q96C24 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
SYTL4Q96C24 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
SYTL4Q96C24 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
SYTL4Q96C24 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
SYTL4Q96C24 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SYTL4Q96C24 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SYTL4Q96C24 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SYTL4Q96C24 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
SYTL4Q96C24 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SYTL4Q96C24 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SYTL4Q96C24 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SYTL4Q96C24 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
SYTL4Q96C24 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SYTL4Q96C24 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SYTL4Q96C24 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
SYTL4Q96C24 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
SYTL4Q96C24 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
SYTL4Q96C24 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SYTL4Q96C24 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SYTL4Q96C24 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SYTL4Q96C24 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
SYTL4Q96C24 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SYTL4Q96C24 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SYTL4Q96C24 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
SYTL4Q96C24 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SYTL4Q96C24 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SYTL4Q96C24 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
SYTL4Q96C24 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SYTL4Q96C24 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
SYTL4Q96C24 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SYTL4Q96C24 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
SYTL4Q96C24 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SYTL4Q96C24 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
SYTL4Q96C24 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SYTL4Q96C24 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SYTL4Q96C24 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SYTL4Q96C24 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SYTL4Q96C24 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SYTL4Q96C24 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
SYTL4Q96C24 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SYTL4Q96C24 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
SYTL4Q96C24 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC31.59■■■□□ 2.65
SYTL4Q96C24 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SYTL4Q96C24 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SYTL4Q96C24 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SYTL4Q96C24 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SYTL4Q96C24 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SYTL4Q96C24 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SYTL4Q96C24 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SYTL4Q96C24 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
SYTL4Q96C24 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
SYTL4Q96C24 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 185.4 ms