Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RFT1Q96AA3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RFT1Q96AA3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RFT1Q96AA3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RFT1Q96AA3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RFT1Q96AA3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RFT1Q96AA3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RFT1Q96AA3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RFT1Q96AA3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RFT1Q96AA3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RFT1Q96AA3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RFT1Q96AA3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RFT1Q96AA3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RFT1Q96AA3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RFT1Q96AA3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RFT1Q96AA3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RFT1Q96AA3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RFT1Q96AA3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RFT1Q96AA3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RFT1Q96AA3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RFT1Q96AA3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RFT1Q96AA3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RFT1Q96AA3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RFT1Q96AA3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RFT1Q96AA3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RFT1Q96AA3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RFT1Q96AA3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RFT1Q96AA3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RFT1Q96AA3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RFT1Q96AA3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RFT1Q96AA3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RFT1Q96AA3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RFT1Q96AA3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RFT1Q96AA3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RFT1Q96AA3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RFT1Q96AA3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RFT1Q96AA3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RFT1Q96AA3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RFT1Q96AA3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RFT1Q96AA3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RFT1Q96AA3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RFT1Q96AA3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RFT1Q96AA3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RFT1Q96AA3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RFT1Q96AA3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RFT1Q96AA3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RFT1Q96AA3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RFT1Q96AA3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RFT1Q96AA3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RFT1Q96AA3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RFT1Q96AA3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RFT1Q96AA3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RFT1Q96AA3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RFT1Q96AA3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RFT1Q96AA3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RFT1Q96AA3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RFT1Q96AA3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RFT1Q96AA3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RFT1Q96AA3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RFT1Q96AA3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RFT1Q96AA3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RFT1Q96AA3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RFT1Q96AA3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RFT1Q96AA3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RFT1Q96AA3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RFT1Q96AA3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RFT1Q96AA3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RFT1Q96AA3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RFT1Q96AA3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RFT1Q96AA3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RFT1Q96AA3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RFT1Q96AA3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RFT1Q96AA3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RFT1Q96AA3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RFT1Q96AA3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RFT1Q96AA3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RFT1Q96AA3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RFT1Q96AA3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RFT1Q96AA3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RFT1Q96AA3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RFT1Q96AA3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RFT1Q96AA3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RFT1Q96AA3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RFT1Q96AA3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RFT1Q96AA3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RFT1Q96AA3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RFT1Q96AA3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RFT1Q96AA3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RFT1Q96AA3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RFT1Q96AA3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RFT1Q96AA3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RFT1Q96AA3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RFT1Q96AA3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RFT1Q96AA3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RFT1Q96AA3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RFT1Q96AA3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RFT1Q96AA3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RFT1Q96AA3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RFT1Q96AA3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RFT1Q96AA3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.5 ms