Protein–RNA interactions for Protein: Q969M7

UBE2F, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2FQ969M7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE2FQ969M7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE2FQ969M7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE2FQ969M7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE2FQ969M7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2FQ969M7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2FQ969M7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2FQ969M7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2FQ969M7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2FQ969M7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2FQ969M7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE2FQ969M7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE2FQ969M7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE2FQ969M7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE2FQ969M7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE2FQ969M7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2FQ969M7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2FQ969M7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2FQ969M7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2FQ969M7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2FQ969M7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2FQ969M7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2FQ969M7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2FQ969M7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2FQ969M7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2FQ969M7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2FQ969M7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2FQ969M7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2FQ969M7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2FQ969M7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2FQ969M7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2FQ969M7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2FQ969M7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2FQ969M7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2FQ969M7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2FQ969M7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2FQ969M7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2FQ969M7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE2FQ969M7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE2FQ969M7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE2FQ969M7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE2FQ969M7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE2FQ969M7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE2FQ969M7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE2FQ969M7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE2FQ969M7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE2FQ969M7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE2FQ969M7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE2FQ969M7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE2FQ969M7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE2FQ969M7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE2FQ969M7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE2FQ969M7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE2FQ969M7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE2FQ969M7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE2FQ969M7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE2FQ969M7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBE2FQ969M7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
UBE2FQ969M7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBE2FQ969M7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBE2FQ969M7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE2FQ969M7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE2FQ969M7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE2FQ969M7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE2FQ969M7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE2FQ969M7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE2FQ969M7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE2FQ969M7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE2FQ969M7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE2FQ969M7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE2FQ969M7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE2FQ969M7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE2FQ969M7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE2FQ969M7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE2FQ969M7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE2FQ969M7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE2FQ969M7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE2FQ969M7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE2FQ969M7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE2FQ969M7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
UBE2FQ969M7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
UBE2FQ969M7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE2FQ969M7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE2FQ969M7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE2FQ969M7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE2FQ969M7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE2FQ969M7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE2FQ969M7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE2FQ969M7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE2FQ969M7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE2FQ969M7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE2FQ969M7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2FQ969M7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2FQ969M7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2FQ969M7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2FQ969M7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2FQ969M7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2FQ969M7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2FQ969M7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2FQ969M7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms