Protein–RNA interactions for Protein: Q92574

TSC1, Hamartin, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC1Q92574 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TSC1Q92574 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TSC1Q92574 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TSC1Q92574 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TSC1Q92574 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TSC1Q92574 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TSC1Q92574 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TSC1Q92574 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TSC1Q92574 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TSC1Q92574 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TSC1Q92574 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TSC1Q92574 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TSC1Q92574 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TSC1Q92574 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TSC1Q92574 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TSC1Q92574 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TSC1Q92574 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TSC1Q92574 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TSC1Q92574 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TSC1Q92574 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TSC1Q92574 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TSC1Q92574 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TSC1Q92574 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TSC1Q92574 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TSC1Q92574 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TSC1Q92574 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TSC1Q92574 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TSC1Q92574 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TSC1Q92574 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TSC1Q92574 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TSC1Q92574 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TSC1Q92574 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TSC1Q92574 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TSC1Q92574 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TSC1Q92574 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TSC1Q92574 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TSC1Q92574 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TSC1Q92574 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TSC1Q92574 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TSC1Q92574 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TSC1Q92574 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TSC1Q92574 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TSC1Q92574 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TSC1Q92574 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TSC1Q92574 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TSC1Q92574 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TSC1Q92574 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TSC1Q92574 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TSC1Q92574 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TSC1Q92574 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TSC1Q92574 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TSC1Q92574 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TSC1Q92574 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TSC1Q92574 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TSC1Q92574 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TSC1Q92574 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TSC1Q92574 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TSC1Q92574 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TSC1Q92574 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TSC1Q92574 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
TSC1Q92574 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TSC1Q92574 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TSC1Q92574 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TSC1Q92574 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TSC1Q92574 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TSC1Q92574 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TSC1Q92574 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TSC1Q92574 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TSC1Q92574 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TSC1Q92574 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TSC1Q92574 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TSC1Q92574 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TSC1Q92574 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TSC1Q92574 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TSC1Q92574 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TSC1Q92574 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TSC1Q92574 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TSC1Q92574 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TSC1Q92574 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TSC1Q92574 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TSC1Q92574 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TSC1Q92574 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TSC1Q92574 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TSC1Q92574 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TSC1Q92574 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TSC1Q92574 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TSC1Q92574 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TSC1Q92574 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TSC1Q92574 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TSC1Q92574 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TSC1Q92574 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TSC1Q92574 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TSC1Q92574 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TSC1Q92574 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TSC1Q92574 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSC1Q92574 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSC1Q92574 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSC1Q92574 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSC1Q92574 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSC1Q92574 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.4 ms