Protein–RNA interactions for Protein: Q92572

AP3S1, AP-3 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S1Q92572 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP3S1Q92572 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP3S1Q92572 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP3S1Q92572 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP3S1Q92572 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP3S1Q92572 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP3S1Q92572 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP3S1Q92572 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP3S1Q92572 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP3S1Q92572 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP3S1Q92572 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP3S1Q92572 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AP3S1Q92572 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AP3S1Q92572 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AP3S1Q92572 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AP3S1Q92572 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AP3S1Q92572 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AP3S1Q92572 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AP3S1Q92572 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AP3S1Q92572 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AP3S1Q92572 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AP3S1Q92572 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AP3S1Q92572 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AP3S1Q92572 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AP3S1Q92572 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.99
AP3S1Q92572 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
AP3S1Q92572 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AP3S1Q92572 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AP3S1Q92572 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AP3S1Q92572 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AP3S1Q92572 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AP3S1Q92572 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AP3S1Q92572 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AP3S1Q92572 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AP3S1Q92572 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AP3S1Q92572 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AP3S1Q92572 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AP3S1Q92572 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AP3S1Q92572 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AP3S1Q92572 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AP3S1Q92572 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AP3S1Q92572 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
AP3S1Q92572 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AP3S1Q92572 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AP3S1Q92572 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AP3S1Q92572 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AP3S1Q92572 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AP3S1Q92572 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AP3S1Q92572 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
AP3S1Q92572 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AP3S1Q92572 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AP3S1Q92572 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AP3S1Q92572 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AP3S1Q92572 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AP3S1Q92572 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AP3S1Q92572 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AP3S1Q92572 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
AP3S1Q92572 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AP3S1Q92572 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AP3S1Q92572 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AP3S1Q92572 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AP3S1Q92572 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
AP3S1Q92572 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AP3S1Q92572 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
AP3S1Q92572 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
AP3S1Q92572 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AP3S1Q92572 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AP3S1Q92572 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
AP3S1Q92572 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AP3S1Q92572 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AP3S1Q92572 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AP3S1Q92572 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AP3S1Q92572 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
AP3S1Q92572 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
AP3S1Q92572 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
AP3S1Q92572 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
AP3S1Q92572 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
AP3S1Q92572 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
AP3S1Q92572 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AP3S1Q92572 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AP3S1Q92572 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AP3S1Q92572 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AP3S1Q92572 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AP3S1Q92572 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AP3S1Q92572 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AP3S1Q92572 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AP3S1Q92572 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AP3S1Q92572 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AP3S1Q92572 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP3S1Q92572 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP3S1Q92572 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP3S1Q92572 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP3S1Q92572 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP3S1Q92572 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP3S1Q92572 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AP3S1Q92572 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AP3S1Q92572 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AP3S1Q92572 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AP3S1Q92572 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AP3S1Q92572 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126 ms