Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC41.63■■■■■ 4.26
TOPBP1Q92547 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
TOPBP1Q92547 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
TOPBP1Q92547 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
TOPBP1Q92547 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC41.63■■■■■ 4.25
TOPBP1Q92547 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC41.63■■■■■ 4.25
TOPBP1Q92547 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
TOPBP1Q92547 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC41.62■■■■■ 4.25
TOPBP1Q92547 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
TOPBP1Q92547 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC41.61■■■■■ 4.25
TOPBP1Q92547 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
TOPBP1Q92547 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC41.61■■■■■ 4.25
TOPBP1Q92547 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
TOPBP1Q92547 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
TOPBP1Q92547 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC41.6■■■■■ 4.25
TOPBP1Q92547 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
TOPBP1Q92547 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC41.59■■■■■ 4.25
TOPBP1Q92547 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
TOPBP1Q92547 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
TOPBP1Q92547 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
TOPBP1Q92547 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC41.58■■■■■ 4.25
TOPBP1Q92547 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC41.58■■■■■ 4.25
TOPBP1Q92547 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC41.58■■■■■ 4.25
TOPBP1Q92547 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC41.58■■■■■ 4.25
TOPBP1Q92547 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC41.57■■■■■ 4.25
TOPBP1Q92547 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
TOPBP1Q92547 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
TOPBP1Q92547 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC41.56■■■■■ 4.24
TOPBP1Q92547 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC41.56■■■■■ 4.24
TOPBP1Q92547 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC41.56■■■■■ 4.24
TOPBP1Q92547 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC41.55■■■■■ 4.24
TOPBP1Q92547 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC41.55■■■■■ 4.24
TOPBP1Q92547 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
TOPBP1Q92547 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
TOPBP1Q92547 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC41.54■■■■■ 4.24
TOPBP1Q92547 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.54■■■■■ 4.24
TOPBP1Q92547 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
TOPBP1Q92547 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
TOPBP1Q92547 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC41.53■■■■■ 4.24
TOPBP1Q92547 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC41.53■■■■■ 4.24
TOPBP1Q92547 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC41.53■■■■■ 4.24
TOPBP1Q92547 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC41.53■■■■■ 4.24
TOPBP1Q92547 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
TOPBP1Q92547 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
TOPBP1Q92547 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
TOPBP1Q92547 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC41.52■■■■■ 4.24
TOPBP1Q92547 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
TOPBP1Q92547 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
TOPBP1Q92547 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC41.51■■■■■ 4.24
TOPBP1Q92547 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC41.51■■■■■ 4.24
TOPBP1Q92547 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.51■■■■■ 4.24
TOPBP1Q92547 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC41.51■■■■■ 4.24
TOPBP1Q92547 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.51■■■■■ 4.24
TOPBP1Q92547 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC41.5■■■■■ 4.23
TOPBP1Q92547 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC41.49■■■■■ 4.23
TOPBP1Q92547 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC41.49■■■■■ 4.23
TOPBP1Q92547 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC41.49■■■■■ 4.23
TOPBP1Q92547 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC41.48■■■■■ 4.23
TOPBP1Q92547 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
TOPBP1Q92547 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC41.48■■■■■ 4.23
TOPBP1Q92547 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC41.48■■■■■ 4.23
TOPBP1Q92547 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC41.48■■■■■ 4.23
TOPBP1Q92547 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC41.48■■■■■ 4.23
TOPBP1Q92547 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
TOPBP1Q92547 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.47■■■■■ 4.23
TOPBP1Q92547 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC41.47■■■■■ 4.23
TOPBP1Q92547 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC41.47■■■■■ 4.23
TOPBP1Q92547 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC41.47■■■■■ 4.23
TOPBP1Q92547 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC41.47■■■■■ 4.23
TOPBP1Q92547 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
TOPBP1Q92547 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC41.46■■■■■ 4.23
TOPBP1Q92547 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.46■■■■■ 4.23
TOPBP1Q92547 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC41.45■■■■■ 4.23
TOPBP1Q92547 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC41.44■■■■■ 4.23
TOPBP1Q92547 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
TOPBP1Q92547 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
TOPBP1Q92547 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC41.44■■■■■ 4.22
TOPBP1Q92547 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC41.44■■■■■ 4.22
TOPBP1Q92547 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC41.43■■■■■ 4.22
TOPBP1Q92547 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
TOPBP1Q92547 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC41.42■■■■■ 4.22
TOPBP1Q92547 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.42■■■■■ 4.22
TOPBP1Q92547 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC41.42■■■■■ 4.22
TOPBP1Q92547 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
TOPBP1Q92547 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC41.41■■■■■ 4.22
TOPBP1Q92547 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC41.41■■■■■ 4.22
TOPBP1Q92547 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
TOPBP1Q92547 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC41.4■■■■■ 4.22
TOPBP1Q92547 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC41.39■■■■■ 4.22
TOPBP1Q92547 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC41.39■■■■■ 4.22
TOPBP1Q92547 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
TOPBP1Q92547 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
TOPBP1Q92547 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC41.37■■■■■ 4.21
TOPBP1Q92547 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
TOPBP1Q92547 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
TOPBP1Q92547 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC41.34■■■■■ 4.21
TOPBP1Q92547 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
TOPBP1Q92547 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC41.34■■■■■ 4.21
TOPBP1Q92547 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
TOPBP1Q92547 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC41.33■■■■■ 4.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms