Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim7Q923T7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim7Q923T7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim7Q923T7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim7Q923T7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim7Q923T7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim7Q923T7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim7Q923T7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim7Q923T7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim7Q923T7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim7Q923T7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim7Q923T7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim7Q923T7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim7Q923T7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim7Q923T7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim7Q923T7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim7Q923T7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim7Q923T7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim7Q923T7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim7Q923T7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim7Q923T7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim7Q923T7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim7Q923T7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim7Q923T7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim7Q923T7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim7Q923T7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim7Q923T7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim7Q923T7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim7Q923T7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim7Q923T7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim7Q923T7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim7Q923T7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim7Q923T7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim7Q923T7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim7Q923T7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim7Q923T7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim7Q923T7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim7Q923T7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim7Q923T7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim7Q923T7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim7Q923T7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim7Q923T7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim7Q923T7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim7Q923T7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim7Q923T7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim7Q923T7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim7Q923T7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim7Q923T7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim7Q923T7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim7Q923T7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim7Q923T7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim7Q923T7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim7Q923T7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim7Q923T7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim7Q923T7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim7Q923T7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim7Q923T7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim7Q923T7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim7Q923T7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim7Q923T7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim7Q923T7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim7Q923T7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim7Q923T7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim7Q923T7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim7Q923T7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim7Q923T7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim7Q923T7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim7Q923T7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim7Q923T7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim7Q923T7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim7Q923T7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim7Q923T7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim7Q923T7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim7Q923T7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim7Q923T7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim7Q923T7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim7Q923T7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim7Q923T7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim7Q923T7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim7Q923T7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim7Q923T7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim7Q923T7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim7Q923T7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim7Q923T7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim7Q923T7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim7Q923T7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim7Q923T7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim7Q923T7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim7Q923T7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim7Q923T7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim7Q923T7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim7Q923T7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim7Q923T7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim7Q923T7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim7Q923T7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim7Q923T7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim7Q923T7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim7Q923T7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim7Q923T7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim7Q923T7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms