Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prpf3Q922U1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prpf3Q922U1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prpf3Q922U1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prpf3Q922U1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prpf3Q922U1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prpf3Q922U1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prpf3Q922U1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prpf3Q922U1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prpf3Q922U1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Prpf3Q922U1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prpf3Q922U1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prpf3Q922U1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prpf3Q922U1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prpf3Q922U1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prpf3Q922U1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prpf3Q922U1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prpf3Q922U1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prpf3Q922U1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prpf3Q922U1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prpf3Q922U1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prpf3Q922U1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prpf3Q922U1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prpf3Q922U1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prpf3Q922U1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prpf3Q922U1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prpf3Q922U1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prpf3Q922U1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Prpf3Q922U1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prpf3Q922U1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prpf3Q922U1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prpf3Q922U1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prpf3Q922U1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prpf3Q922U1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prpf3Q922U1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prpf3Q922U1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prpf3Q922U1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prpf3Q922U1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prpf3Q922U1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prpf3Q922U1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prpf3Q922U1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Prpf3Q922U1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prpf3Q922U1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prpf3Q922U1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prpf3Q922U1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prpf3Q922U1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prpf3Q922U1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prpf3Q922U1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prpf3Q922U1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prpf3Q922U1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Prpf3Q922U1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Prpf3Q922U1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prpf3Q922U1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prpf3Q922U1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prpf3Q922U1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prpf3Q922U1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prpf3Q922U1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prpf3Q922U1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prpf3Q922U1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Prpf3Q922U1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prpf3Q922U1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prpf3Q922U1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prpf3Q922U1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prpf3Q922U1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prpf3Q922U1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prpf3Q922U1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prpf3Q922U1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prpf3Q922U1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prpf3Q922U1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Prpf3Q922U1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prpf3Q922U1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prpf3Q922U1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Prpf3Q922U1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prpf3Q922U1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prpf3Q922U1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prpf3Q922U1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prpf3Q922U1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prpf3Q922U1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prpf3Q922U1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prpf3Q922U1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prpf3Q922U1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prpf3Q922U1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prpf3Q922U1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prpf3Q922U1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prpf3Q922U1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prpf3Q922U1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prpf3Q922U1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prpf3Q922U1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prpf3Q922U1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prpf3Q922U1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prpf3Q922U1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prpf3Q922U1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prpf3Q922U1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prpf3Q922U1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prpf3Q922U1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prpf3Q922U1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prpf3Q922U1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prpf3Q922U1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prpf3Q922U1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prpf3Q922U1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms