Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Afg3l1Q920A7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Afg3l1Q920A7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Afg3l1Q920A7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Afg3l1Q920A7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Afg3l1Q920A7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Afg3l1Q920A7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Afg3l1Q920A7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Afg3l1Q920A7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Afg3l1Q920A7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Afg3l1Q920A7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Afg3l1Q920A7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Afg3l1Q920A7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Afg3l1Q920A7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Afg3l1Q920A7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Afg3l1Q920A7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Afg3l1Q920A7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Afg3l1Q920A7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Afg3l1Q920A7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Afg3l1Q920A7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Afg3l1Q920A7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Afg3l1Q920A7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Afg3l1Q920A7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Afg3l1Q920A7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Afg3l1Q920A7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Afg3l1Q920A7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Afg3l1Q920A7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Afg3l1Q920A7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Afg3l1Q920A7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Afg3l1Q920A7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Afg3l1Q920A7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Afg3l1Q920A7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Afg3l1Q920A7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Afg3l1Q920A7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Afg3l1Q920A7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Afg3l1Q920A7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Afg3l1Q920A7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Afg3l1Q920A7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Afg3l1Q920A7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Afg3l1Q920A7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Afg3l1Q920A7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Afg3l1Q920A7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Afg3l1Q920A7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Afg3l1Q920A7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Afg3l1Q920A7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Afg3l1Q920A7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Afg3l1Q920A7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Afg3l1Q920A7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Afg3l1Q920A7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Afg3l1Q920A7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Afg3l1Q920A7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Afg3l1Q920A7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Afg3l1Q920A7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Afg3l1Q920A7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Afg3l1Q920A7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Afg3l1Q920A7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Afg3l1Q920A7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Afg3l1Q920A7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Afg3l1Q920A7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Afg3l1Q920A7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Afg3l1Q920A7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Afg3l1Q920A7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Afg3l1Q920A7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Afg3l1Q920A7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Afg3l1Q920A7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Afg3l1Q920A7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Afg3l1Q920A7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Afg3l1Q920A7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Afg3l1Q920A7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Afg3l1Q920A7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Afg3l1Q920A7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Afg3l1Q920A7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Afg3l1Q920A7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Afg3l1Q920A7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Afg3l1Q920A7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Afg3l1Q920A7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Afg3l1Q920A7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Afg3l1Q920A7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Afg3l1Q920A7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Afg3l1Q920A7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Afg3l1Q920A7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Afg3l1Q920A7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Afg3l1Q920A7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Afg3l1Q920A7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Afg3l1Q920A7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Afg3l1Q920A7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Afg3l1Q920A7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Afg3l1Q920A7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Afg3l1Q920A7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Afg3l1Q920A7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Afg3l1Q920A7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Afg3l1Q920A7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Afg3l1Q920A7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Afg3l1Q920A7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Afg3l1Q920A7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Afg3l1Q920A7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Afg3l1Q920A7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Afg3l1Q920A7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Afg3l1Q920A7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Afg3l1Q920A7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms