Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usb1Q91W78 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usb1Q91W78 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usb1Q91W78 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usb1Q91W78 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usb1Q91W78 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usb1Q91W78 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usb1Q91W78 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usb1Q91W78 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usb1Q91W78 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usb1Q91W78 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usb1Q91W78 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usb1Q91W78 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usb1Q91W78 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usb1Q91W78 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usb1Q91W78 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usb1Q91W78 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usb1Q91W78 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usb1Q91W78 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usb1Q91W78 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usb1Q91W78 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usb1Q91W78 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usb1Q91W78 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usb1Q91W78 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usb1Q91W78 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usb1Q91W78 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usb1Q91W78 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usb1Q91W78 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usb1Q91W78 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usb1Q91W78 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usb1Q91W78 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usb1Q91W78 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usb1Q91W78 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usb1Q91W78 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usb1Q91W78 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Usb1Q91W78 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usb1Q91W78 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usb1Q91W78 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usb1Q91W78 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usb1Q91W78 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usb1Q91W78 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usb1Q91W78 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usb1Q91W78 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usb1Q91W78 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usb1Q91W78 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usb1Q91W78 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usb1Q91W78 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usb1Q91W78 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usb1Q91W78 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usb1Q91W78 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usb1Q91W78 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usb1Q91W78 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usb1Q91W78 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usb1Q91W78 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usb1Q91W78 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usb1Q91W78 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usb1Q91W78 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usb1Q91W78 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usb1Q91W78 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usb1Q91W78 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usb1Q91W78 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usb1Q91W78 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usb1Q91W78 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Usb1Q91W78 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usb1Q91W78 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usb1Q91W78 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usb1Q91W78 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usb1Q91W78 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usb1Q91W78 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usb1Q91W78 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usb1Q91W78 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usb1Q91W78 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usb1Q91W78 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usb1Q91W78 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usb1Q91W78 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usb1Q91W78 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Usb1Q91W78 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usb1Q91W78 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usb1Q91W78 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usb1Q91W78 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usb1Q91W78 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usb1Q91W78 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usb1Q91W78 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usb1Q91W78 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usb1Q91W78 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usb1Q91W78 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usb1Q91W78 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usb1Q91W78 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usb1Q91W78 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usb1Q91W78 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usb1Q91W78 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usb1Q91W78 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usb1Q91W78 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usb1Q91W78 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usb1Q91W78 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usb1Q91W78 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usb1Q91W78 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usb1Q91W78 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usb1Q91W78 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usb1Q91W78 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms