Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bgrl3Q91VW3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bgrl3Q91VW3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bgrl3Q91VW3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bgrl3Q91VW3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bgrl3Q91VW3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bgrl3Q91VW3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bgrl3Q91VW3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bgrl3Q91VW3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bgrl3Q91VW3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bgrl3Q91VW3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bgrl3Q91VW3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bgrl3Q91VW3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bgrl3Q91VW3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bgrl3Q91VW3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bgrl3Q91VW3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bgrl3Q91VW3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bgrl3Q91VW3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bgrl3Q91VW3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bgrl3Q91VW3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bgrl3Q91VW3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bgrl3Q91VW3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bgrl3Q91VW3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bgrl3Q91VW3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bgrl3Q91VW3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bgrl3Q91VW3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bgrl3Q91VW3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bgrl3Q91VW3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bgrl3Q91VW3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bgrl3Q91VW3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bgrl3Q91VW3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bgrl3Q91VW3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bgrl3Q91VW3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bgrl3Q91VW3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bgrl3Q91VW3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bgrl3Q91VW3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bgrl3Q91VW3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bgrl3Q91VW3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bgrl3Q91VW3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sh3bgrl3Q91VW3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh3bgrl3Q91VW3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms