Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
CSRNP3Q8WYN3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
CSRNP3Q8WYN3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC40.04■■■■■ 4
CSRNP3Q8WYN3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
CSRNP3Q8WYN3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
CSRNP3Q8WYN3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
CSRNP3Q8WYN3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC40.03■■■■■ 4
CSRNP3Q8WYN3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
CSRNP3Q8WYN3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC40.02■■■■■ 4
CSRNP3Q8WYN3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC40.01■■■■■ 4
CSRNP3Q8WYN3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC40.01■■■■■ 4
CSRNP3Q8WYN3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
CSRNP3Q8WYN3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
CSRNP3Q8WYN3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC39.99■■■■□ 3.99
CSRNP3Q8WYN3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC39.99■■■■□ 3.99
CSRNP3Q8WYN3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
CSRNP3Q8WYN3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC39.99■■■■□ 3.99
CSRNP3Q8WYN3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
CSRNP3Q8WYN3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC39.98■■■■□ 3.99
CSRNP3Q8WYN3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
CSRNP3Q8WYN3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC39.97■■■■□ 3.99
CSRNP3Q8WYN3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
CSRNP3Q8WYN3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC39.97■■■■□ 3.99
CSRNP3Q8WYN3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC39.97■■■■□ 3.99
CSRNP3Q8WYN3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.97■■■■□ 3.99
CSRNP3Q8WYN3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.97■■■■□ 3.99
CSRNP3Q8WYN3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
CSRNP3Q8WYN3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.96■■■■□ 3.99
CSRNP3Q8WYN3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
CSRNP3Q8WYN3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC39.96■■■■□ 3.99
CSRNP3Q8WYN3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
CSRNP3Q8WYN3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
CSRNP3Q8WYN3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC39.95■■■■□ 3.99
CSRNP3Q8WYN3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC39.94■■■■□ 3.98
CSRNP3Q8WYN3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.93■■■■□ 3.98
CSRNP3Q8WYN3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC39.93■■■■□ 3.98
CSRNP3Q8WYN3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC39.93■■■■□ 3.98
CSRNP3Q8WYN3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
CSRNP3Q8WYN3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC39.92■■■■□ 3.98
CSRNP3Q8WYN3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC39.92■■■■□ 3.98
CSRNP3Q8WYN3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
CSRNP3Q8WYN3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
CSRNP3Q8WYN3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
CSRNP3Q8WYN3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
CSRNP3Q8WYN3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
CSRNP3Q8WYN3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
CSRNP3Q8WYN3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
CSRNP3Q8WYN3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
CSRNP3Q8WYN3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
CSRNP3Q8WYN3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
CSRNP3Q8WYN3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
CSRNP3Q8WYN3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC39.89■■■■□ 3.98
CSRNP3Q8WYN3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC39.88■■■■□ 3.97
CSRNP3Q8WYN3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC39.88■■■■□ 3.97
CSRNP3Q8WYN3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
CSRNP3Q8WYN3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
CSRNP3Q8WYN3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
CSRNP3Q8WYN3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC39.86■■■■□ 3.97
CSRNP3Q8WYN3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
CSRNP3Q8WYN3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
CSRNP3Q8WYN3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
CSRNP3Q8WYN3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
CSRNP3Q8WYN3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
CSRNP3Q8WYN3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
CSRNP3Q8WYN3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
CSRNP3Q8WYN3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC39.83■■■■□ 3.97
CSRNP3Q8WYN3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
CSRNP3Q8WYN3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC39.82■■■■□ 3.97
CSRNP3Q8WYN3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
CSRNP3Q8WYN3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC39.82■■■■□ 3.97
CSRNP3Q8WYN3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.82■■■■□ 3.96
CSRNP3Q8WYN3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
CSRNP3Q8WYN3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
CSRNP3Q8WYN3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
CSRNP3Q8WYN3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC39.8■■■■□ 3.96
CSRNP3Q8WYN3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
CSRNP3Q8WYN3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
CSRNP3Q8WYN3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
CSRNP3Q8WYN3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
CSRNP3Q8WYN3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
CSRNP3Q8WYN3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC39.8■■■■□ 3.96
CSRNP3Q8WYN3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
CSRNP3Q8WYN3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.79■■■■□ 3.96
CSRNP3Q8WYN3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC39.79■■■■□ 3.96
CSRNP3Q8WYN3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC39.79■■■■□ 3.96
CSRNP3Q8WYN3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC39.79■■■■□ 3.96
CSRNP3Q8WYN3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
CSRNP3Q8WYN3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC39.79■■■■□ 3.96
CSRNP3Q8WYN3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC39.79■■■■□ 3.96
CSRNP3Q8WYN3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
CSRNP3Q8WYN3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
CSRNP3Q8WYN3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
CSRNP3Q8WYN3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC39.77■■■■□ 3.96
CSRNP3Q8WYN3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
CSRNP3Q8WYN3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
CSRNP3Q8WYN3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
CSRNP3Q8WYN3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.76■■■■□ 3.96
CSRNP3Q8WYN3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
CSRNP3Q8WYN3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
CSRNP3Q8WYN3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms