Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVK7

SKA2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKA2Q8WVK7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SKA2Q8WVK7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SKA2Q8WVK7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SKA2Q8WVK7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SKA2Q8WVK7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SKA2Q8WVK7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SKA2Q8WVK7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SKA2Q8WVK7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SKA2Q8WVK7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SKA2Q8WVK7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SKA2Q8WVK7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SKA2Q8WVK7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SKA2Q8WVK7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKA2Q8WVK7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKA2Q8WVK7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKA2Q8WVK7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKA2Q8WVK7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKA2Q8WVK7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SKA2Q8WVK7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SKA2Q8WVK7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SKA2Q8WVK7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SKA2Q8WVK7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKA2Q8WVK7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKA2Q8WVK7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKA2Q8WVK7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKA2Q8WVK7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKA2Q8WVK7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKA2Q8WVK7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKA2Q8WVK7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKA2Q8WVK7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKA2Q8WVK7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKA2Q8WVK7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKA2Q8WVK7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SKA2Q8WVK7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SKA2Q8WVK7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SKA2Q8WVK7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SKA2Q8WVK7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SKA2Q8WVK7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SKA2Q8WVK7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SKA2Q8WVK7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SKA2Q8WVK7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SKA2Q8WVK7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SKA2Q8WVK7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SKA2Q8WVK7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SKA2Q8WVK7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SKA2Q8WVK7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SKA2Q8WVK7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SKA2Q8WVK7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SKA2Q8WVK7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SKA2Q8WVK7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SKA2Q8WVK7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SKA2Q8WVK7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SKA2Q8WVK7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SKA2Q8WVK7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SKA2Q8WVK7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SKA2Q8WVK7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SKA2Q8WVK7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SKA2Q8WVK7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKA2Q8WVK7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SKA2Q8WVK7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SKA2Q8WVK7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKA2Q8WVK7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKA2Q8WVK7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKA2Q8WVK7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKA2Q8WVK7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKA2Q8WVK7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKA2Q8WVK7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKA2Q8WVK7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SKA2Q8WVK7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKA2Q8WVK7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKA2Q8WVK7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKA2Q8WVK7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKA2Q8WVK7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKA2Q8WVK7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKA2Q8WVK7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKA2Q8WVK7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKA2Q8WVK7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKA2Q8WVK7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKA2Q8WVK7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKA2Q8WVK7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKA2Q8WVK7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKA2Q8WVK7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SKA2Q8WVK7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SKA2Q8WVK7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SKA2Q8WVK7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SKA2Q8WVK7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SKA2Q8WVK7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SKA2Q8WVK7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SKA2Q8WVK7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SKA2Q8WVK7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SKA2Q8WVK7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKA2Q8WVK7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKA2Q8WVK7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKA2Q8WVK7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKA2Q8WVK7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKA2Q8WVK7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SKA2Q8WVK7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SKA2Q8WVK7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SKA2Q8WVK7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SKA2Q8WVK7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms