Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHW2

Cacng8, Voltage-dependent calcium channel gamma-8 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng8Q8VHW2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacng8Q8VHW2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacng8Q8VHW2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacng8Q8VHW2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacng8Q8VHW2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacng8Q8VHW2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacng8Q8VHW2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacng8Q8VHW2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacng8Q8VHW2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacng8Q8VHW2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacng8Q8VHW2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacng8Q8VHW2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacng8Q8VHW2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacng8Q8VHW2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacng8Q8VHW2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacng8Q8VHW2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacng8Q8VHW2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacng8Q8VHW2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacng8Q8VHW2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacng8Q8VHW2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacng8Q8VHW2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacng8Q8VHW2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacng8Q8VHW2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacng8Q8VHW2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacng8Q8VHW2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacng8Q8VHW2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacng8Q8VHW2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacng8Q8VHW2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacng8Q8VHW2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacng8Q8VHW2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacng8Q8VHW2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacng8Q8VHW2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacng8Q8VHW2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacng8Q8VHW2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacng8Q8VHW2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacng8Q8VHW2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacng8Q8VHW2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacng8Q8VHW2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacng8Q8VHW2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacng8Q8VHW2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacng8Q8VHW2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacng8Q8VHW2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacng8Q8VHW2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacng8Q8VHW2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacng8Q8VHW2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacng8Q8VHW2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacng8Q8VHW2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacng8Q8VHW2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacng8Q8VHW2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacng8Q8VHW2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacng8Q8VHW2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacng8Q8VHW2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacng8Q8VHW2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacng8Q8VHW2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacng8Q8VHW2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacng8Q8VHW2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacng8Q8VHW2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacng8Q8VHW2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacng8Q8VHW2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacng8Q8VHW2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacng8Q8VHW2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacng8Q8VHW2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacng8Q8VHW2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacng8Q8VHW2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacng8Q8VHW2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacng8Q8VHW2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacng8Q8VHW2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacng8Q8VHW2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacng8Q8VHW2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacng8Q8VHW2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacng8Q8VHW2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacng8Q8VHW2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacng8Q8VHW2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacng8Q8VHW2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacng8Q8VHW2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacng8Q8VHW2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacng8Q8VHW2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacng8Q8VHW2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacng8Q8VHW2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacng8Q8VHW2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacng8Q8VHW2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacng8Q8VHW2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacng8Q8VHW2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacng8Q8VHW2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacng8Q8VHW2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacng8Q8VHW2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacng8Q8VHW2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacng8Q8VHW2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacng8Q8VHW2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacng8Q8VHW2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacng8Q8VHW2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacng8Q8VHW2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacng8Q8VHW2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacng8Q8VHW2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacng8Q8VHW2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacng8Q8VHW2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacng8Q8VHW2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacng8Q8VHW2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacng8Q8VHW2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacng8Q8VHW2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 230.1 ms