Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEE1

Lmcd1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmcd1Q8VEE1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lmcd1Q8VEE1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lmcd1Q8VEE1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lmcd1Q8VEE1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lmcd1Q8VEE1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lmcd1Q8VEE1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lmcd1Q8VEE1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lmcd1Q8VEE1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lmcd1Q8VEE1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lmcd1Q8VEE1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lmcd1Q8VEE1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lmcd1Q8VEE1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lmcd1Q8VEE1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lmcd1Q8VEE1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lmcd1Q8VEE1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lmcd1Q8VEE1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lmcd1Q8VEE1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lmcd1Q8VEE1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Lmcd1Q8VEE1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lmcd1Q8VEE1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lmcd1Q8VEE1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lmcd1Q8VEE1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lmcd1Q8VEE1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lmcd1Q8VEE1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lmcd1Q8VEE1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lmcd1Q8VEE1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lmcd1Q8VEE1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lmcd1Q8VEE1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lmcd1Q8VEE1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lmcd1Q8VEE1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lmcd1Q8VEE1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lmcd1Q8VEE1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lmcd1Q8VEE1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lmcd1Q8VEE1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lmcd1Q8VEE1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lmcd1Q8VEE1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lmcd1Q8VEE1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lmcd1Q8VEE1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lmcd1Q8VEE1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lmcd1Q8VEE1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lmcd1Q8VEE1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lmcd1Q8VEE1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lmcd1Q8VEE1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lmcd1Q8VEE1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lmcd1Q8VEE1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lmcd1Q8VEE1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lmcd1Q8VEE1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lmcd1Q8VEE1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lmcd1Q8VEE1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lmcd1Q8VEE1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lmcd1Q8VEE1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Lmcd1Q8VEE1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lmcd1Q8VEE1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lmcd1Q8VEE1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Lmcd1Q8VEE1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lmcd1Q8VEE1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lmcd1Q8VEE1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lmcd1Q8VEE1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lmcd1Q8VEE1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lmcd1Q8VEE1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lmcd1Q8VEE1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lmcd1Q8VEE1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lmcd1Q8VEE1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lmcd1Q8VEE1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lmcd1Q8VEE1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lmcd1Q8VEE1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmcd1Q8VEE1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmcd1Q8VEE1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmcd1Q8VEE1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmcd1Q8VEE1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmcd1Q8VEE1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmcd1Q8VEE1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmcd1Q8VEE1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmcd1Q8VEE1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmcd1Q8VEE1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmcd1Q8VEE1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmcd1Q8VEE1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmcd1Q8VEE1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmcd1Q8VEE1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmcd1Q8VEE1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmcd1Q8VEE1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Lmcd1Q8VEE1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lmcd1Q8VEE1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lmcd1Q8VEE1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lmcd1Q8VEE1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lmcd1Q8VEE1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lmcd1Q8VEE1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lmcd1Q8VEE1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lmcd1Q8VEE1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lmcd1Q8VEE1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lmcd1Q8VEE1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lmcd1Q8VEE1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Lmcd1Q8VEE1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lmcd1Q8VEE1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lmcd1Q8VEE1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lmcd1Q8VEE1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lmcd1Q8VEE1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lmcd1Q8VEE1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lmcd1Q8VEE1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lmcd1Q8VEE1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms