Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc6a20aQ8VDB9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc6a20aQ8VDB9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc6a20aQ8VDB9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc6a20aQ8VDB9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc6a20aQ8VDB9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc6a20aQ8VDB9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc6a20aQ8VDB9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc6a20aQ8VDB9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc6a20aQ8VDB9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc6a20aQ8VDB9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc6a20aQ8VDB9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc6a20aQ8VDB9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc6a20aQ8VDB9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc6a20aQ8VDB9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Slc6a20aQ8VDB9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc6a20aQ8VDB9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc6a20aQ8VDB9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc6a20aQ8VDB9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc6a20aQ8VDB9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc6a20aQ8VDB9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc6a20aQ8VDB9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc6a20aQ8VDB9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc6a20aQ8VDB9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc6a20aQ8VDB9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc6a20aQ8VDB9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc6a20aQ8VDB9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc6a20aQ8VDB9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc6a20aQ8VDB9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc6a20aQ8VDB9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc6a20aQ8VDB9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc6a20aQ8VDB9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc6a20aQ8VDB9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc6a20aQ8VDB9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc6a20aQ8VDB9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc6a20aQ8VDB9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc6a20aQ8VDB9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc6a20aQ8VDB9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc6a20aQ8VDB9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc6a20aQ8VDB9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc6a20aQ8VDB9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc6a20aQ8VDB9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc6a20aQ8VDB9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc6a20aQ8VDB9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc6a20aQ8VDB9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc6a20aQ8VDB9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc6a20aQ8VDB9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Slc6a20aQ8VDB9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc6a20aQ8VDB9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc6a20aQ8VDB9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc6a20aQ8VDB9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc6a20aQ8VDB9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc6a20aQ8VDB9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc6a20aQ8VDB9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc6a20aQ8VDB9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc6a20aQ8VDB9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc6a20aQ8VDB9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc6a20aQ8VDB9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc6a20aQ8VDB9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc6a20aQ8VDB9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc6a20aQ8VDB9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc6a20aQ8VDB9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc6a20aQ8VDB9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc6a20aQ8VDB9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc6a20aQ8VDB9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc6a20aQ8VDB9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc6a20aQ8VDB9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc6a20aQ8VDB9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc6a20aQ8VDB9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc6a20aQ8VDB9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc6a20aQ8VDB9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc6a20aQ8VDB9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc6a20aQ8VDB9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc6a20aQ8VDB9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc6a20aQ8VDB9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc6a20aQ8VDB9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc6a20aQ8VDB9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc6a20aQ8VDB9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc6a20aQ8VDB9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc6a20aQ8VDB9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Slc6a20aQ8VDB9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc6a20aQ8VDB9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc6a20aQ8VDB9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc6a20aQ8VDB9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc6a20aQ8VDB9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc6a20aQ8VDB9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc6a20aQ8VDB9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc6a20aQ8VDB9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc6a20aQ8VDB9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc6a20aQ8VDB9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc6a20aQ8VDB9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc6a20aQ8VDB9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc6a20aQ8VDB9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc6a20aQ8VDB9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc6a20aQ8VDB9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc6a20aQ8VDB9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc6a20aQ8VDB9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc6a20aQ8VDB9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc6a20aQ8VDB9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc6a20aQ8VDB9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
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