Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCW2

Krt25, Keratin, type I cytoskeletal 25, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt25Q8VCW2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Krt25Q8VCW2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Krt25Q8VCW2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Krt25Q8VCW2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Krt25Q8VCW2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Krt25Q8VCW2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Krt25Q8VCW2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Krt25Q8VCW2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Krt25Q8VCW2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Krt25Q8VCW2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Krt25Q8VCW2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Krt25Q8VCW2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Krt25Q8VCW2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Krt25Q8VCW2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Krt25Q8VCW2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Krt25Q8VCW2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Krt25Q8VCW2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Krt25Q8VCW2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Krt25Q8VCW2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Krt25Q8VCW2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Krt25Q8VCW2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Krt25Q8VCW2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Krt25Q8VCW2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Krt25Q8VCW2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Krt25Q8VCW2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Krt25Q8VCW2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Krt25Q8VCW2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Krt25Q8VCW2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Krt25Q8VCW2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Krt25Q8VCW2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Krt25Q8VCW2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Krt25Q8VCW2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Krt25Q8VCW2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Krt25Q8VCW2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Krt25Q8VCW2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Krt25Q8VCW2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Krt25Q8VCW2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Krt25Q8VCW2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Krt25Q8VCW2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Krt25Q8VCW2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Krt25Q8VCW2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Krt25Q8VCW2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Krt25Q8VCW2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Krt25Q8VCW2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Krt25Q8VCW2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Krt25Q8VCW2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Krt25Q8VCW2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Krt25Q8VCW2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Krt25Q8VCW2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Krt25Q8VCW2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Krt25Q8VCW2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Krt25Q8VCW2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Krt25Q8VCW2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Krt25Q8VCW2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Krt25Q8VCW2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Krt25Q8VCW2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Krt25Q8VCW2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Krt25Q8VCW2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Krt25Q8VCW2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Krt25Q8VCW2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Krt25Q8VCW2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Krt25Q8VCW2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Krt25Q8VCW2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Krt25Q8VCW2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Krt25Q8VCW2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Krt25Q8VCW2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Krt25Q8VCW2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Krt25Q8VCW2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Krt25Q8VCW2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Krt25Q8VCW2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Krt25Q8VCW2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Krt25Q8VCW2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Krt25Q8VCW2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Krt25Q8VCW2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Krt25Q8VCW2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Krt25Q8VCW2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Krt25Q8VCW2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Krt25Q8VCW2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Krt25Q8VCW2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Krt25Q8VCW2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Krt25Q8VCW2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Krt25Q8VCW2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Krt25Q8VCW2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Krt25Q8VCW2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Krt25Q8VCW2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Krt25Q8VCW2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Krt25Q8VCW2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Krt25Q8VCW2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Krt25Q8VCW2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Krt25Q8VCW2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Krt25Q8VCW2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Krt25Q8VCW2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Krt25Q8VCW2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Krt25Q8VCW2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Krt25Q8VCW2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Krt25Q8VCW2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Krt25Q8VCW2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Krt25Q8VCW2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Krt25Q8VCW2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Krt25Q8VCW2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms