Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC05

MDM1, Nuclear protein MDM1, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM1Q8TC05 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MDM1Q8TC05 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MDM1Q8TC05 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MDM1Q8TC05 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MDM1Q8TC05 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MDM1Q8TC05 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MDM1Q8TC05 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MDM1Q8TC05 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MDM1Q8TC05 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MDM1Q8TC05 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MDM1Q8TC05 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MDM1Q8TC05 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MDM1Q8TC05 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MDM1Q8TC05 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MDM1Q8TC05 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MDM1Q8TC05 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MDM1Q8TC05 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MDM1Q8TC05 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MDM1Q8TC05 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MDM1Q8TC05 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MDM1Q8TC05 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MDM1Q8TC05 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MDM1Q8TC05 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MDM1Q8TC05 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MDM1Q8TC05 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MDM1Q8TC05 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MDM1Q8TC05 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MDM1Q8TC05 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MDM1Q8TC05 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MDM1Q8TC05 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MDM1Q8TC05 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MDM1Q8TC05 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MDM1Q8TC05 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MDM1Q8TC05 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MDM1Q8TC05 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MDM1Q8TC05 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MDM1Q8TC05 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MDM1Q8TC05 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MDM1Q8TC05 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MDM1Q8TC05 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MDM1Q8TC05 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MDM1Q8TC05 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MDM1Q8TC05 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MDM1Q8TC05 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MDM1Q8TC05 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MDM1Q8TC05 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MDM1Q8TC05 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MDM1Q8TC05 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MDM1Q8TC05 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MDM1Q8TC05 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MDM1Q8TC05 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MDM1Q8TC05 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MDM1Q8TC05 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MDM1Q8TC05 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MDM1Q8TC05 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MDM1Q8TC05 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MDM1Q8TC05 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MDM1Q8TC05 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
MDM1Q8TC05 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MDM1Q8TC05 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MDM1Q8TC05 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MDM1Q8TC05 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MDM1Q8TC05 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MDM1Q8TC05 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MDM1Q8TC05 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MDM1Q8TC05 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MDM1Q8TC05 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MDM1Q8TC05 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MDM1Q8TC05 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MDM1Q8TC05 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MDM1Q8TC05 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MDM1Q8TC05 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MDM1Q8TC05 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MDM1Q8TC05 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MDM1Q8TC05 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MDM1Q8TC05 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MDM1Q8TC05 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MDM1Q8TC05 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MDM1Q8TC05 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MDM1Q8TC05 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MDM1Q8TC05 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MDM1Q8TC05 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MDM1Q8TC05 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MDM1Q8TC05 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MDM1Q8TC05 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MDM1Q8TC05 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MDM1Q8TC05 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MDM1Q8TC05 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MDM1Q8TC05 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MDM1Q8TC05 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MDM1Q8TC05 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MDM1Q8TC05 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MDM1Q8TC05 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MDM1Q8TC05 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MDM1Q8TC05 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MDM1Q8TC05 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MDM1Q8TC05 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MDM1Q8TC05 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MDM1Q8TC05 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MDM1Q8TC05 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms