Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAL5

C9orf43, Uncharacterized protein C9orf43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf43Q8TAL5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C9orf43Q8TAL5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C9orf43Q8TAL5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C9orf43Q8TAL5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C9orf43Q8TAL5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C9orf43Q8TAL5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C9orf43Q8TAL5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C9orf43Q8TAL5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
C9orf43Q8TAL5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C9orf43Q8TAL5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
C9orf43Q8TAL5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
C9orf43Q8TAL5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C9orf43Q8TAL5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C9orf43Q8TAL5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C9orf43Q8TAL5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C9orf43Q8TAL5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C9orf43Q8TAL5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
C9orf43Q8TAL5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
C9orf43Q8TAL5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C9orf43Q8TAL5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C9orf43Q8TAL5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C9orf43Q8TAL5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C9orf43Q8TAL5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C9orf43Q8TAL5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C9orf43Q8TAL5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C9orf43Q8TAL5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C9orf43Q8TAL5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C9orf43Q8TAL5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C9orf43Q8TAL5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C9orf43Q8TAL5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C9orf43Q8TAL5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C9orf43Q8TAL5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
C9orf43Q8TAL5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
C9orf43Q8TAL5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C9orf43Q8TAL5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C9orf43Q8TAL5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C9orf43Q8TAL5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C9orf43Q8TAL5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C9orf43Q8TAL5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C9orf43Q8TAL5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C9orf43Q8TAL5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C9orf43Q8TAL5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C9orf43Q8TAL5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C9orf43Q8TAL5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C9orf43Q8TAL5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C9orf43Q8TAL5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C9orf43Q8TAL5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C9orf43Q8TAL5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9orf43Q8TAL5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9orf43Q8TAL5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9orf43Q8TAL5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9orf43Q8TAL5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
C9orf43Q8TAL5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
C9orf43Q8TAL5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9orf43Q8TAL5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9orf43Q8TAL5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9orf43Q8TAL5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9orf43Q8TAL5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C9orf43Q8TAL5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C9orf43Q8TAL5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C9orf43Q8TAL5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C9orf43Q8TAL5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C9orf43Q8TAL5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9orf43Q8TAL5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9orf43Q8TAL5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9orf43Q8TAL5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
C9orf43Q8TAL5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9orf43Q8TAL5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9orf43Q8TAL5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
C9orf43Q8TAL5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C9orf43Q8TAL5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C9orf43Q8TAL5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C9orf43Q8TAL5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C9orf43Q8TAL5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C9orf43Q8TAL5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C9orf43Q8TAL5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
C9orf43Q8TAL5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9orf43Q8TAL5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9orf43Q8TAL5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9orf43Q8TAL5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C9orf43Q8TAL5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C9orf43Q8TAL5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C9orf43Q8TAL5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C9orf43Q8TAL5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C9orf43Q8TAL5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C9orf43Q8TAL5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C9orf43Q8TAL5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C9orf43Q8TAL5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C9orf43Q8TAL5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C9orf43Q8TAL5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C9orf43Q8TAL5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C9orf43Q8TAL5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C9orf43Q8TAL5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
C9orf43Q8TAL5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
C9orf43Q8TAL5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
C9orf43Q8TAL5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C9orf43Q8TAL5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C9orf43Q8TAL5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C9orf43Q8TAL5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C9orf43Q8TAL5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms