Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2U2

Nepro, Nucleolus and neural progenitor protein, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeproQ8R2U2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NeproQ8R2U2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NeproQ8R2U2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NeproQ8R2U2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NeproQ8R2U2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NeproQ8R2U2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NeproQ8R2U2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NeproQ8R2U2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NeproQ8R2U2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NeproQ8R2U2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NeproQ8R2U2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NeproQ8R2U2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NeproQ8R2U2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NeproQ8R2U2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NeproQ8R2U2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NeproQ8R2U2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NeproQ8R2U2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NeproQ8R2U2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NeproQ8R2U2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NeproQ8R2U2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NeproQ8R2U2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NeproQ8R2U2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NeproQ8R2U2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NeproQ8R2U2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NeproQ8R2U2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NeproQ8R2U2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NeproQ8R2U2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NeproQ8R2U2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NeproQ8R2U2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NeproQ8R2U2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NeproQ8R2U2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NeproQ8R2U2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NeproQ8R2U2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NeproQ8R2U2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NeproQ8R2U2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NeproQ8R2U2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NeproQ8R2U2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NeproQ8R2U2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NeproQ8R2U2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NeproQ8R2U2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NeproQ8R2U2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NeproQ8R2U2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NeproQ8R2U2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NeproQ8R2U2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NeproQ8R2U2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NeproQ8R2U2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NeproQ8R2U2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NeproQ8R2U2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NeproQ8R2U2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NeproQ8R2U2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NeproQ8R2U2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NeproQ8R2U2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NeproQ8R2U2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NeproQ8R2U2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NeproQ8R2U2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NeproQ8R2U2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NeproQ8R2U2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NeproQ8R2U2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NeproQ8R2U2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NeproQ8R2U2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NeproQ8R2U2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NeproQ8R2U2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NeproQ8R2U2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NeproQ8R2U2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NeproQ8R2U2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NeproQ8R2U2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NeproQ8R2U2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NeproQ8R2U2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NeproQ8R2U2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NeproQ8R2U2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NeproQ8R2U2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NeproQ8R2U2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NeproQ8R2U2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NeproQ8R2U2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NeproQ8R2U2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NeproQ8R2U2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NeproQ8R2U2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NeproQ8R2U2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NeproQ8R2U2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NeproQ8R2U2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NeproQ8R2U2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NeproQ8R2U2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NeproQ8R2U2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NeproQ8R2U2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NeproQ8R2U2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NeproQ8R2U2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NeproQ8R2U2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NeproQ8R2U2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NeproQ8R2U2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NeproQ8R2U2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NeproQ8R2U2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NeproQ8R2U2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NeproQ8R2U2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NeproQ8R2U2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NeproQ8R2U2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NeproQ8R2U2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NeproQ8R2U2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NeproQ8R2U2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NeproQ8R2U2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NeproQ8R2U2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms