Protein–RNA interactions for Protein: Q8NI35

PATJ, InaD-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATJQ8NI35 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PATJQ8NI35 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PATJQ8NI35 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PATJQ8NI35 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PATJQ8NI35 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PATJQ8NI35 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PATJQ8NI35 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PATJQ8NI35 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PATJQ8NI35 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PATJQ8NI35 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PATJQ8NI35 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PATJQ8NI35 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PATJQ8NI35 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PATJQ8NI35 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PATJQ8NI35 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PATJQ8NI35 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PATJQ8NI35 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PATJQ8NI35 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PATJQ8NI35 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PATJQ8NI35 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PATJQ8NI35 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PATJQ8NI35 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PATJQ8NI35 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PATJQ8NI35 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PATJQ8NI35 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PATJQ8NI35 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PATJQ8NI35 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PATJQ8NI35 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PATJQ8NI35 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PATJQ8NI35 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PATJQ8NI35 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PATJQ8NI35 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PATJQ8NI35 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PATJQ8NI35 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PATJQ8NI35 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PATJQ8NI35 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PATJQ8NI35 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PATJQ8NI35 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PATJQ8NI35 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PATJQ8NI35 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PATJQ8NI35 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PATJQ8NI35 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PATJQ8NI35 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PATJQ8NI35 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PATJQ8NI35 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PATJQ8NI35 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PATJQ8NI35 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PATJQ8NI35 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PATJQ8NI35 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PATJQ8NI35 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PATJQ8NI35 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PATJQ8NI35 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PATJQ8NI35 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PATJQ8NI35 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PATJQ8NI35 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PATJQ8NI35 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PATJQ8NI35 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PATJQ8NI35 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PATJQ8NI35 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PATJQ8NI35 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms