Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEC5

CATSPER1, Cation channel sperm-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER1Q8NEC5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CATSPER1Q8NEC5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CATSPER1Q8NEC5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CATSPER1Q8NEC5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CATSPER1Q8NEC5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CATSPER1Q8NEC5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CATSPER1Q8NEC5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CATSPER1Q8NEC5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CATSPER1Q8NEC5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CATSPER1Q8NEC5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CATSPER1Q8NEC5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CATSPER1Q8NEC5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CATSPER1Q8NEC5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CATSPER1Q8NEC5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CATSPER1Q8NEC5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CATSPER1Q8NEC5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CATSPER1Q8NEC5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CATSPER1Q8NEC5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CATSPER1Q8NEC5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CATSPER1Q8NEC5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CATSPER1Q8NEC5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CATSPER1Q8NEC5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CATSPER1Q8NEC5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CATSPER1Q8NEC5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CATSPER1Q8NEC5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CATSPER1Q8NEC5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CATSPER1Q8NEC5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CATSPER1Q8NEC5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CATSPER1Q8NEC5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CATSPER1Q8NEC5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CATSPER1Q8NEC5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CATSPER1Q8NEC5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CATSPER1Q8NEC5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CATSPER1Q8NEC5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CATSPER1Q8NEC5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CATSPER1Q8NEC5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CATSPER1Q8NEC5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CATSPER1Q8NEC5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CATSPER1Q8NEC5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CATSPER1Q8NEC5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CATSPER1Q8NEC5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CATSPER1Q8NEC5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CATSPER1Q8NEC5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CATSPER1Q8NEC5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CATSPER1Q8NEC5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CATSPER1Q8NEC5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CATSPER1Q8NEC5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CATSPER1Q8NEC5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CATSPER1Q8NEC5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CATSPER1Q8NEC5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CATSPER1Q8NEC5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CATSPER1Q8NEC5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CATSPER1Q8NEC5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CATSPER1Q8NEC5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CATSPER1Q8NEC5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CATSPER1Q8NEC5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CATSPER1Q8NEC5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CATSPER1Q8NEC5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CATSPER1Q8NEC5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CATSPER1Q8NEC5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CATSPER1Q8NEC5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CATSPER1Q8NEC5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CATSPER1Q8NEC5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CATSPER1Q8NEC5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CATSPER1Q8NEC5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CATSPER1Q8NEC5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CATSPER1Q8NEC5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CATSPER1Q8NEC5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CATSPER1Q8NEC5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CATSPER1Q8NEC5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CATSPER1Q8NEC5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CATSPER1Q8NEC5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CATSPER1Q8NEC5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CATSPER1Q8NEC5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CATSPER1Q8NEC5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CATSPER1Q8NEC5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CATSPER1Q8NEC5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CATSPER1Q8NEC5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CATSPER1Q8NEC5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CATSPER1Q8NEC5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CATSPER1Q8NEC5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CATSPER1Q8NEC5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CATSPER1Q8NEC5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CATSPER1Q8NEC5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CATSPER1Q8NEC5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CATSPER1Q8NEC5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CATSPER1Q8NEC5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CATSPER1Q8NEC5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CATSPER1Q8NEC5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CATSPER1Q8NEC5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CATSPER1Q8NEC5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CATSPER1Q8NEC5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CATSPER1Q8NEC5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CATSPER1Q8NEC5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CATSPER1Q8NEC5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CATSPER1Q8NEC5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CATSPER1Q8NEC5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CATSPER1Q8NEC5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CATSPER1Q8NEC5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CATSPER1Q8NEC5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 183.1 ms