Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY8

TMEM52, Transmembrane protein 52, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM52Q8NDY8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM52Q8NDY8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM52Q8NDY8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM52Q8NDY8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM52Q8NDY8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM52Q8NDY8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM52Q8NDY8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM52Q8NDY8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM52Q8NDY8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM52Q8NDY8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM52Q8NDY8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM52Q8NDY8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM52Q8NDY8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM52Q8NDY8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM52Q8NDY8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM52Q8NDY8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM52Q8NDY8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM52Q8NDY8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM52Q8NDY8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM52Q8NDY8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM52Q8NDY8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM52Q8NDY8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM52Q8NDY8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM52Q8NDY8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM52Q8NDY8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM52Q8NDY8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM52Q8NDY8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM52Q8NDY8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM52Q8NDY8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM52Q8NDY8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM52Q8NDY8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM52Q8NDY8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM52Q8NDY8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM52Q8NDY8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM52Q8NDY8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TMEM52Q8NDY8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM52Q8NDY8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM52Q8NDY8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM52Q8NDY8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM52Q8NDY8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM52Q8NDY8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM52Q8NDY8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM52Q8NDY8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM52Q8NDY8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM52Q8NDY8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM52Q8NDY8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM52Q8NDY8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM52Q8NDY8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM52Q8NDY8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM52Q8NDY8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM52Q8NDY8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM52Q8NDY8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM52Q8NDY8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM52Q8NDY8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM52Q8NDY8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM52Q8NDY8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM52Q8NDY8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM52Q8NDY8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM52Q8NDY8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM52Q8NDY8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM52Q8NDY8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM52Q8NDY8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM52Q8NDY8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM52Q8NDY8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM52Q8NDY8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM52Q8NDY8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM52Q8NDY8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM52Q8NDY8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM52Q8NDY8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM52Q8NDY8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM52Q8NDY8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM52Q8NDY8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM52Q8NDY8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM52Q8NDY8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMEM52Q8NDY8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM52Q8NDY8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM52Q8NDY8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM52Q8NDY8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM52Q8NDY8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM52Q8NDY8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM52Q8NDY8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM52Q8NDY8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM52Q8NDY8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM52Q8NDY8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM52Q8NDY8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM52Q8NDY8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM52Q8NDY8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM52Q8NDY8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM52Q8NDY8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM52Q8NDY8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM52Q8NDY8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM52Q8NDY8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM52Q8NDY8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM52Q8NDY8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM52Q8NDY8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM52Q8NDY8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM52Q8NDY8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM52Q8NDY8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM52Q8NDY8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM52Q8NDY8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms