Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS7

SLC44A5, Choline transporter-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A5Q8NCS7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC44A5Q8NCS7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC44A5Q8NCS7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC44A5Q8NCS7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC44A5Q8NCS7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC44A5Q8NCS7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC44A5Q8NCS7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SLC44A5Q8NCS7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
SLC44A5Q8NCS7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLC44A5Q8NCS7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLC44A5Q8NCS7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLC44A5Q8NCS7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLC44A5Q8NCS7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLC44A5Q8NCS7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC44A5Q8NCS7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC44A5Q8NCS7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC44A5Q8NCS7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC44A5Q8NCS7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC44A5Q8NCS7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC44A5Q8NCS7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC44A5Q8NCS7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC44A5Q8NCS7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC44A5Q8NCS7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC44A5Q8NCS7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC44A5Q8NCS7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC44A5Q8NCS7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC44A5Q8NCS7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC44A5Q8NCS7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLC44A5Q8NCS7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLC44A5Q8NCS7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLC44A5Q8NCS7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLC44A5Q8NCS7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLC44A5Q8NCS7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLC44A5Q8NCS7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC44A5Q8NCS7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC44A5Q8NCS7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC44A5Q8NCS7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC44A5Q8NCS7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC44A5Q8NCS7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC44A5Q8NCS7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC44A5Q8NCS7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC44A5Q8NCS7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
SLC44A5Q8NCS7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC44A5Q8NCS7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC44A5Q8NCS7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC44A5Q8NCS7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC44A5Q8NCS7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC44A5Q8NCS7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC44A5Q8NCS7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLC44A5Q8NCS7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SLC44A5Q8NCS7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC44A5Q8NCS7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC44A5Q8NCS7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC44A5Q8NCS7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC44A5Q8NCS7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC44A5Q8NCS7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC44A5Q8NCS7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC44A5Q8NCS7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC44A5Q8NCS7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC44A5Q8NCS7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC44A5Q8NCS7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC44A5Q8NCS7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC44A5Q8NCS7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC44A5Q8NCS7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC44A5Q8NCS7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC44A5Q8NCS7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC44A5Q8NCS7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC44A5Q8NCS7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC44A5Q8NCS7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC44A5Q8NCS7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC44A5Q8NCS7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC44A5Q8NCS7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC44A5Q8NCS7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC44A5Q8NCS7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC44A5Q8NCS7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC44A5Q8NCS7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC44A5Q8NCS7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC44A5Q8NCS7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC44A5Q8NCS7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC44A5Q8NCS7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC44A5Q8NCS7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC44A5Q8NCS7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC44A5Q8NCS7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC44A5Q8NCS7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC44A5Q8NCS7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC44A5Q8NCS7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC44A5Q8NCS7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC44A5Q8NCS7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC44A5Q8NCS7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC44A5Q8NCS7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC44A5Q8NCS7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC44A5Q8NCS7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC44A5Q8NCS7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC44A5Q8NCS7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC44A5Q8NCS7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC44A5Q8NCS7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC44A5Q8NCS7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC44A5Q8NCS7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC44A5Q8NCS7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC44A5Q8NCS7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms