Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8D1

PDCD7, Programmed cell death protein 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD7Q8N8D1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDCD7Q8N8D1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDCD7Q8N8D1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PDCD7Q8N8D1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDCD7Q8N8D1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDCD7Q8N8D1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDCD7Q8N8D1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDCD7Q8N8D1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDCD7Q8N8D1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDCD7Q8N8D1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDCD7Q8N8D1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDCD7Q8N8D1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDCD7Q8N8D1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDCD7Q8N8D1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDCD7Q8N8D1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDCD7Q8N8D1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDCD7Q8N8D1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDCD7Q8N8D1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDCD7Q8N8D1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDCD7Q8N8D1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDCD7Q8N8D1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDCD7Q8N8D1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDCD7Q8N8D1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDCD7Q8N8D1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDCD7Q8N8D1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDCD7Q8N8D1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDCD7Q8N8D1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDCD7Q8N8D1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDCD7Q8N8D1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDCD7Q8N8D1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDCD7Q8N8D1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDCD7Q8N8D1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDCD7Q8N8D1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDCD7Q8N8D1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDCD7Q8N8D1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDCD7Q8N8D1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDCD7Q8N8D1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDCD7Q8N8D1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PDCD7Q8N8D1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDCD7Q8N8D1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDCD7Q8N8D1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDCD7Q8N8D1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDCD7Q8N8D1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDCD7Q8N8D1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDCD7Q8N8D1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDCD7Q8N8D1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDCD7Q8N8D1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PDCD7Q8N8D1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PDCD7Q8N8D1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDCD7Q8N8D1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDCD7Q8N8D1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDCD7Q8N8D1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDCD7Q8N8D1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDCD7Q8N8D1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDCD7Q8N8D1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDCD7Q8N8D1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDCD7Q8N8D1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDCD7Q8N8D1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDCD7Q8N8D1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDCD7Q8N8D1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDCD7Q8N8D1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PDCD7Q8N8D1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDCD7Q8N8D1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDCD7Q8N8D1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDCD7Q8N8D1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDCD7Q8N8D1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDCD7Q8N8D1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDCD7Q8N8D1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDCD7Q8N8D1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDCD7Q8N8D1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDCD7Q8N8D1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PDCD7Q8N8D1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDCD7Q8N8D1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDCD7Q8N8D1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDCD7Q8N8D1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDCD7Q8N8D1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDCD7Q8N8D1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDCD7Q8N8D1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PDCD7Q8N8D1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDCD7Q8N8D1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDCD7Q8N8D1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDCD7Q8N8D1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDCD7Q8N8D1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDCD7Q8N8D1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDCD7Q8N8D1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDCD7Q8N8D1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDCD7Q8N8D1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDCD7Q8N8D1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDCD7Q8N8D1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDCD7Q8N8D1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDCD7Q8N8D1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDCD7Q8N8D1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDCD7Q8N8D1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDCD7Q8N8D1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDCD7Q8N8D1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDCD7Q8N8D1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDCD7Q8N8D1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDCD7Q8N8D1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDCD7Q8N8D1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PDCD7Q8N8D1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 284.8 ms