Protein–RNA interactions for Protein: Q8N431

RASGEF1C, Ras-GEF domain-containing family member 1C, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1CQ8N431 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RASGEF1CQ8N431 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RASGEF1CQ8N431 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RASGEF1CQ8N431 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RASGEF1CQ8N431 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RASGEF1CQ8N431 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RASGEF1CQ8N431 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RASGEF1CQ8N431 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RASGEF1CQ8N431 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RASGEF1CQ8N431 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RASGEF1CQ8N431 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RASGEF1CQ8N431 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RASGEF1CQ8N431 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RASGEF1CQ8N431 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RASGEF1CQ8N431 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RASGEF1CQ8N431 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RASGEF1CQ8N431 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RASGEF1CQ8N431 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RASGEF1CQ8N431 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RASGEF1CQ8N431 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RASGEF1CQ8N431 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RASGEF1CQ8N431 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RASGEF1CQ8N431 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RASGEF1CQ8N431 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RASGEF1CQ8N431 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RASGEF1CQ8N431 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RASGEF1CQ8N431 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RASGEF1CQ8N431 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RASGEF1CQ8N431 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RASGEF1CQ8N431 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RASGEF1CQ8N431 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RASGEF1CQ8N431 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RASGEF1CQ8N431 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RASGEF1CQ8N431 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RASGEF1CQ8N431 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RASGEF1CQ8N431 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RASGEF1CQ8N431 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RASGEF1CQ8N431 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RASGEF1CQ8N431 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RASGEF1CQ8N431 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RASGEF1CQ8N431 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RASGEF1CQ8N431 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RASGEF1CQ8N431 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RASGEF1CQ8N431 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RASGEF1CQ8N431 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RASGEF1CQ8N431 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RASGEF1CQ8N431 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RASGEF1CQ8N431 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RASGEF1CQ8N431 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RASGEF1CQ8N431 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RASGEF1CQ8N431 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RASGEF1CQ8N431 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RASGEF1CQ8N431 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RASGEF1CQ8N431 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RASGEF1CQ8N431 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RASGEF1CQ8N431 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RASGEF1CQ8N431 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RASGEF1CQ8N431 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RASGEF1CQ8N431 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RASGEF1CQ8N431 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RASGEF1CQ8N431 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RASGEF1CQ8N431 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RASGEF1CQ8N431 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RASGEF1CQ8N431 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RASGEF1CQ8N431 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RASGEF1CQ8N431 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RASGEF1CQ8N431 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RASGEF1CQ8N431 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RASGEF1CQ8N431 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RASGEF1CQ8N431 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RASGEF1CQ8N431 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RASGEF1CQ8N431 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RASGEF1CQ8N431 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RASGEF1CQ8N431 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RASGEF1CQ8N431 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RASGEF1CQ8N431 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RASGEF1CQ8N431 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RASGEF1CQ8N431 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RASGEF1CQ8N431 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RASGEF1CQ8N431 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RASGEF1CQ8N431 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RASGEF1CQ8N431 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RASGEF1CQ8N431 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RASGEF1CQ8N431 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RASGEF1CQ8N431 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RASGEF1CQ8N431 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RASGEF1CQ8N431 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RASGEF1CQ8N431 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RASGEF1CQ8N431 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RASGEF1CQ8N431 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RASGEF1CQ8N431 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RASGEF1CQ8N431 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RASGEF1CQ8N431 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RASGEF1CQ8N431 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RASGEF1CQ8N431 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RASGEF1CQ8N431 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RASGEF1CQ8N431 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RASGEF1CQ8N431 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RASGEF1CQ8N431 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RASGEF1CQ8N431 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.5 ms