Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2H9

PELI3, E3 ubiquitin-protein ligase pellino homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PELI3Q8N2H9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PELI3Q8N2H9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PELI3Q8N2H9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PELI3Q8N2H9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PELI3Q8N2H9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PELI3Q8N2H9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PELI3Q8N2H9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PELI3Q8N2H9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PELI3Q8N2H9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PELI3Q8N2H9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PELI3Q8N2H9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PELI3Q8N2H9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PELI3Q8N2H9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PELI3Q8N2H9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PELI3Q8N2H9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PELI3Q8N2H9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PELI3Q8N2H9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PELI3Q8N2H9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PELI3Q8N2H9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PELI3Q8N2H9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PELI3Q8N2H9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PELI3Q8N2H9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PELI3Q8N2H9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PELI3Q8N2H9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PELI3Q8N2H9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PELI3Q8N2H9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PELI3Q8N2H9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PELI3Q8N2H9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PELI3Q8N2H9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PELI3Q8N2H9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PELI3Q8N2H9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PELI3Q8N2H9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PELI3Q8N2H9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PELI3Q8N2H9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PELI3Q8N2H9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PELI3Q8N2H9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PELI3Q8N2H9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PELI3Q8N2H9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PELI3Q8N2H9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PELI3Q8N2H9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PELI3Q8N2H9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PELI3Q8N2H9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PELI3Q8N2H9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PELI3Q8N2H9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PELI3Q8N2H9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PELI3Q8N2H9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PELI3Q8N2H9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PELI3Q8N2H9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PELI3Q8N2H9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PELI3Q8N2H9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PELI3Q8N2H9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PELI3Q8N2H9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PELI3Q8N2H9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PELI3Q8N2H9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PELI3Q8N2H9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PELI3Q8N2H9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PELI3Q8N2H9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PELI3Q8N2H9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PELI3Q8N2H9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PELI3Q8N2H9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PELI3Q8N2H9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PELI3Q8N2H9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PELI3Q8N2H9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PELI3Q8N2H9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PELI3Q8N2H9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PELI3Q8N2H9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PELI3Q8N2H9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PELI3Q8N2H9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PELI3Q8N2H9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PELI3Q8N2H9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PELI3Q8N2H9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PELI3Q8N2H9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PELI3Q8N2H9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PELI3Q8N2H9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PELI3Q8N2H9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PELI3Q8N2H9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PELI3Q8N2H9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PELI3Q8N2H9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PELI3Q8N2H9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PELI3Q8N2H9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PELI3Q8N2H9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PELI3Q8N2H9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PELI3Q8N2H9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PELI3Q8N2H9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PELI3Q8N2H9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PELI3Q8N2H9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PELI3Q8N2H9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PELI3Q8N2H9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PELI3Q8N2H9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PELI3Q8N2H9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PELI3Q8N2H9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PELI3Q8N2H9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PELI3Q8N2H9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PELI3Q8N2H9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PELI3Q8N2H9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PELI3Q8N2H9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PELI3Q8N2H9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PELI3Q8N2H9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PELI3Q8N2H9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PELI3Q8N2H9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms