Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1W1

ARHGEF28, Rho guanine nucleotide exchange factor 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF28Q8N1W1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ARHGEF28Q8N1W1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ARHGEF28Q8N1W1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ARHGEF28Q8N1W1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ARHGEF28Q8N1W1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ARHGEF28Q8N1W1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
ARHGEF28Q8N1W1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ARHGEF28Q8N1W1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ARHGEF28Q8N1W1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ARHGEF28Q8N1W1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ARHGEF28Q8N1W1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ARHGEF28Q8N1W1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ARHGEF28Q8N1W1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ARHGEF28Q8N1W1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ARHGEF28Q8N1W1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ARHGEF28Q8N1W1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
ARHGEF28Q8N1W1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ARHGEF28Q8N1W1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ARHGEF28Q8N1W1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ARHGEF28Q8N1W1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ARHGEF28Q8N1W1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ARHGEF28Q8N1W1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ARHGEF28Q8N1W1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ARHGEF28Q8N1W1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
ARHGEF28Q8N1W1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ARHGEF28Q8N1W1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ARHGEF28Q8N1W1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ARHGEF28Q8N1W1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ARHGEF28Q8N1W1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
ARHGEF28Q8N1W1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ARHGEF28Q8N1W1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ARHGEF28Q8N1W1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
ARHGEF28Q8N1W1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
ARHGEF28Q8N1W1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ARHGEF28Q8N1W1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ARHGEF28Q8N1W1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ARHGEF28Q8N1W1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ARHGEF28Q8N1W1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ARHGEF28Q8N1W1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ARHGEF28Q8N1W1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
ARHGEF28Q8N1W1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ARHGEF28Q8N1W1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
ARHGEF28Q8N1W1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
ARHGEF28Q8N1W1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
ARHGEF28Q8N1W1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
ARHGEF28Q8N1W1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
ARHGEF28Q8N1W1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
ARHGEF28Q8N1W1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
ARHGEF28Q8N1W1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ARHGEF28Q8N1W1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ARHGEF28Q8N1W1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ARHGEF28Q8N1W1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ARHGEF28Q8N1W1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ARHGEF28Q8N1W1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ARHGEF28Q8N1W1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ARHGEF28Q8N1W1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ARHGEF28Q8N1W1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ARHGEF28Q8N1W1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ARHGEF28Q8N1W1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ARHGEF28Q8N1W1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ARHGEF28Q8N1W1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ARHGEF28Q8N1W1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
ARHGEF28Q8N1W1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ARHGEF28Q8N1W1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
ARHGEF28Q8N1W1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ARHGEF28Q8N1W1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
ARHGEF28Q8N1W1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ARHGEF28Q8N1W1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
ARHGEF28Q8N1W1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
ARHGEF28Q8N1W1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
ARHGEF28Q8N1W1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
ARHGEF28Q8N1W1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
ARHGEF28Q8N1W1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
ARHGEF28Q8N1W1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
ARHGEF28Q8N1W1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
ARHGEF28Q8N1W1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
ARHGEF28Q8N1W1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
ARHGEF28Q8N1W1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ARHGEF28Q8N1W1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ARHGEF28Q8N1W1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ARHGEF28Q8N1W1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ARHGEF28Q8N1W1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ARHGEF28Q8N1W1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
ARHGEF28Q8N1W1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
ARHGEF28Q8N1W1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
ARHGEF28Q8N1W1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
ARHGEF28Q8N1W1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
ARHGEF28Q8N1W1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
ARHGEF28Q8N1W1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
ARHGEF28Q8N1W1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
ARHGEF28Q8N1W1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ARHGEF28Q8N1W1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ARHGEF28Q8N1W1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
ARHGEF28Q8N1W1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ARHGEF28Q8N1W1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ARHGEF28Q8N1W1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
ARHGEF28Q8N1W1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ARHGEF28Q8N1W1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ARHGEF28Q8N1W1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ARHGEF28Q8N1W1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms