Protein–RNA interactions for Protein: Q8K212

Pacs1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs1Q8K212 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pacs1Q8K212 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pacs1Q8K212 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pacs1Q8K212 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pacs1Q8K212 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pacs1Q8K212 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pacs1Q8K212 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pacs1Q8K212 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pacs1Q8K212 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Pacs1Q8K212 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pacs1Q8K212 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pacs1Q8K212 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pacs1Q8K212 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pacs1Q8K212 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pacs1Q8K212 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pacs1Q8K212 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pacs1Q8K212 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pacs1Q8K212 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pacs1Q8K212 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pacs1Q8K212 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pacs1Q8K212 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pacs1Q8K212 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pacs1Q8K212 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pacs1Q8K212 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pacs1Q8K212 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pacs1Q8K212 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pacs1Q8K212 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pacs1Q8K212 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pacs1Q8K212 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pacs1Q8K212 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pacs1Q8K212 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pacs1Q8K212 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pacs1Q8K212 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pacs1Q8K212 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pacs1Q8K212 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pacs1Q8K212 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pacs1Q8K212 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pacs1Q8K212 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pacs1Q8K212 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pacs1Q8K212 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pacs1Q8K212 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pacs1Q8K212 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pacs1Q8K212 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pacs1Q8K212 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pacs1Q8K212 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pacs1Q8K212 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pacs1Q8K212 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pacs1Q8K212 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Pacs1Q8K212 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pacs1Q8K212 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pacs1Q8K212 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pacs1Q8K212 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pacs1Q8K212 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pacs1Q8K212 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pacs1Q8K212 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pacs1Q8K212 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pacs1Q8K212 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Pacs1Q8K212 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pacs1Q8K212 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Pacs1Q8K212 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Pacs1Q8K212 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pacs1Q8K212 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pacs1Q8K212 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pacs1Q8K212 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pacs1Q8K212 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pacs1Q8K212 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pacs1Q8K212 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pacs1Q8K212 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pacs1Q8K212 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pacs1Q8K212 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pacs1Q8K212 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pacs1Q8K212 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pacs1Q8K212 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pacs1Q8K212 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pacs1Q8K212 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pacs1Q8K212 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pacs1Q8K212 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pacs1Q8K212 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pacs1Q8K212 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pacs1Q8K212 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pacs1Q8K212 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pacs1Q8K212 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pacs1Q8K212 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pacs1Q8K212 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pacs1Q8K212 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pacs1Q8K212 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pacs1Q8K212 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pacs1Q8K212 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pacs1Q8K212 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pacs1Q8K212 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pacs1Q8K212 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pacs1Q8K212 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pacs1Q8K212 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pacs1Q8K212 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pacs1Q8K212 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Pacs1Q8K212 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pacs1Q8K212 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pacs1Q8K212 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pacs1Q8K212 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pacs1Q8K212 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms